Keras：“运行时错误：导入 pydot 失败。”安装 graphviz 和 pydot 后答案

【问题标题】：Keras: "RuntimeError: Failed to import pydot." after installing graphviz and pydotKeras：“运行时错误：导入 pydot 失败。”安装 graphviz 和 pydot 后
【发布时间】：2016-08-21 13:37:14
【问题描述】：

我在 Windows 10 上使用 Anaconda Python 2.7

我正计划进行 Keras 可视化，所以（当 spyder 打开时）我打开了 Anaconda 命令提示符并 pip 安装了 graphviz 和 pydot。现在，当我尝试运行以下命令时：

from keras.models import Sequential

或任何形式的“来自 keras”。，我得到错误：

ImportError: cannot import name gof

我已经卸载并重新安装了 Keras、Graphviz 和 pydot。我正在使用theano的开发版本。我找不到修复方法。

附言

如果我卸载 graphviz 和 pydot，keras 会再次运行

编辑

卸载 anaconda 并重新安装后，包括 theano、keras、graphviz 和 pydot，我现在收到以下错误：

from keras.utils.visualize_util import plot

Using Theano backend.
Using gpu device 0: GeForce GTX 970M (CNMeM is disabled, cuDNN not available)
Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-1-65016ddab3cd>", line 1, in <module>
  from keras.utils.visualize_util import plot

  File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\keras\utils\visualize_util.py", line  8, in <module>
  raise RuntimeError('Failed to import pydot. You must install pydot'

RuntimeError: Failed to import pydot. You must install pydot and graphviz  for `pydotprint` to work.

我用过pip install graphviz和pip install git+https://github.com/nlhepler/pydot.git

【问题讨论】：

你能从python粘贴完整的错误信息吗？
Keras 现在再次运行。但是没有安装 Graphviz 和 Pydot 包。当我之前尝试在 python 上卸载它们时，每次打开它时都会崩溃，这就是为什么我不敢尝试重新安装任何一个包的原因。会不会是其中一个妨碍了 Keras？
通过您的编辑，问题现在发生了重大变化，您应该编辑标题以反映新问题。
我已经在stackoverflow.com/a/47433183/1074998 用逐步调试技术回答了类似的问题

标签： python graphviz theano keras pydot

【解决方案1】：

错误信息有点误导，你可以看到here。问题是graphviz没有安装。

但是你提到graphviz是使用pip安装的。这也是一种误导，因为该 graphviz 包只是一个 python 包装器，并且必须单独安装 graphviz binaries 才能使 python 包装器工作。

【讨论】：

我有类似的问题。在许多类似问题中解决我的问题的唯一答案。谢谢！
谢谢，错误信息具有误导性，当 sudo yum install graphviz 时，它已修复
sudo apt-get install graphviz
在 Windows 10 中，从 graphviz.org/Download_windows.php 下载 .msi 安装程序，然后运行它。安装完成后，确保将 GraphViz 二进制文件 (C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin) 的路径添加到 windows PATH 变量中。您可能需要重新启动 Python 内核才能正确选择路径。
对于刚刚运行的 Windows，conda install graphviz 和 pip install pydot

【解决方案2】：

如果您使用的是 Anaconda 环境，最好通过conda install 安装pydotplus 和graphviz。

conda install graphviz
conda install pydotplus

注意：您最好将您的 Keras 更新到最新版本（2.0.9+），它会自动检查并选择要使用pydotplus、pydot-ng、pydot 中的哪一个。 pydot-ng很久没维护了，目前只支持py3.4-和py2.7。

【讨论】：

【解决方案3】：

我所做的事情被遵循了。

import keras
import pydotplus
from keras.utils.vis_utils import model_to_dot
keras.utils.vis_utils.pydot = pydot

plot_model(your_model_name, to_file='model.png')

这对我有用。在 mac 上 Anaconda python=3.6.8

【讨论】：

扩展视图plot_model(model, to_file='model_plot.png', show_shapes=True, show_layer_names=True)

【解决方案4】：

Keras 2.0.6 会查找 pydot-ng（维护得更好），如果没有找到，则使用 pydot。我通过从source 安装 pydot-ng 解决了这个问题。

【讨论】：

【解决方案5】：

我遇到了同样的问题。我在 Ubuntu 上使用 Anaconda python。但似乎 Keras 使用系统的 python 而不是 Anaconda python。最初，我使用 conda 安装了 pydot 和 graphviz。当我在系统的 python 中安装 pydot 和 graphviz（使用 /usr/bin/pip install pydot）时，它工作正常。

【讨论】：

但我在 Windows 上使用 Anaconda。我知道在我的情况下有一条蟒蛇。即使那样它也失败了。关于什么可能是错误的任何想法？

【解决方案6】：

在osx中通过brew安装graphvizbrew install graphviz，ubuntu使用apt-get install graphviz，不需要通过pip安装graphviz。

【讨论】：

这不是问题的答案。
@phd 你试过了吗？ “pip install pydot”然后“brew install graphviz”，它会工作
至少对于 Ubuntu 机器来说，这就像一个魅力
如果还是不行，执行“pip install pydot-ng”

【解决方案7】：

我的 Keras（没有 anaconda）也有类似的问题。我已经用这种方式解决了我的问题

sudo pip install pydot
sudo pip install graphviz
sudo add-apt-repository ppa:gviz-adm/graphviz-dev
sudo apt-get update
sudo apt-get install graphviz-dev

【讨论】：

【解决方案8】：

1)Conda 安装 graphviz
2)pip install graphviz
3)pip 安装 pydot
那么：

import os os.environ["PATH"] += os.pathsep + AppData\\Local\\Continuum\\anaconda3\\envs\\tensorflow\\Library\\bin\\graphviz'

【讨论】：

【解决方案9】：

对于 Mac 上的 Anaconda：

使用 conda run 安装这个包：

conda install -c anaconda graphviz

【讨论】：

【解决方案10】：

将graphviz 安装到系统中。从here 下载包，或在 Mac 上：
```
brew install graphviz
```

安装 python pydot-ng 和 graphviz 包装器。

pip install pydot-ng graphviz
conda install -c anaconda pydot-ng #Anaconda user

在您的代码中使用pydot-ng
```
import pydot_ng as pydot
```
如果 Keras 可视化 utils 仍然使用 pydot，请尝试将 visualize_util.py 中的 import pydot 更改为 import pydot_ng as pydot

【讨论】：

【解决方案11】：

以下内容在运行在 jupyter/tensorflow-notebook docker 容器中的 jupyter 笔记本中运行。

!conda install -y graphviz pydotplus

import pydotplus
import keras.utils
keras.utils.vis_utils.pydot = pydotplus
keras.utils.plot_model(your_model_name, to_file='model.png', show_shapes=True)

你需要告诉 keras 使用 pydotplus

【讨论】：

【解决方案12】：

如果你是通过 pip 安装的，它与 pydot 或 graphviz 无关。

你应该去下载graphviz brinary并安装。

不要忘记将 bin 文件夹添加到 PATH：C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/

然后关闭并重新打开您的控制台。

【讨论】：

【解决方案13】：

安装pydot和graphviz并将graphviz添加到路径后，您可以重启 IDE或终端。 see here.

【讨论】：