如何在 Google Colaboratory 上安装 libspatialindex答案

【问题标题】：How to install libspatialindex on Google Colaboratory如何在 Google Colaboratory 上安装 libspatialindex
【发布时间】：2018-06-25 21:22:53
【问题描述】：

为了使用 Python 高效分析空间数据，我使用了 rtree 空间索引库，依赖于 libspatialindex C 库。

我能够使用 !pip install rtree 在 Google Colaboratory notebook 中成功安装 rtree。

正如预期的那样，这还不够，因为需要首先安装 libspatialindex，正如import rtree 所确认的那样，结果是：

OSError: Could not find libspatialindex_c library file

我不确定是否以及如何在 Google Collaboratory 中安装外部库。在https://github.com/libspatialindex/libspatialindex/wiki/1.-Getting-Started 之后，我设法运行!curl -L http://download.osgeo.org/libspatialindex/spatialindex-src-1.8.5.tar.gz | tar xz，但我没有配置权限： !spatialindex-src-1.8.5/configure

/bin/sh: 1: spatialindex-src-1.8.5/configure: Permission denied

【问题讨论】：

标签： r-tree google-colaboratory libspatialindex

【解决方案1】：

编辑：该错误似乎已修复。构建不再需要下面的!mount ... 命令。我已经相应地更新了the example notebook。

原始响应如下。

这看起来像一个 Colab 错误。 /content 目录挂载了noexec，这是导致权限错误的原因。

在修复之前，您可以使用以下命令重新挂载 /content 并获得所需的 exec 权限：

!mount -o remount,exec /content

这是安装libspatialindex 和rtree 的完整笔记本。 https://colab.research.google.com/notebook#fileId=1N7i9zmOwVcUzd4eHWZux4p_WTBMZHi8C

【讨论】：

感谢您的精彩回复，这很有帮助。一个小的附加问题 - 有没有办法在笔记本之间保持这个安装（这里是合作新手，所以我不确定）。我承认这个后续问题是 OOT
配置它的最简单方法可能是在折叠部分的顶部添加一个单元格，以便在需要时执行安装，例如，colab.research.google.com/…
是的，可以，但是需要很多时间，而且在重复使用笔记本之间似乎没有必要。
嗨，我在修复此错误时遇到问题：SError: 找不到 libspatialindex_c 库文件，我按照此处推荐的笔记本安装该库，但它仍然显示。不得不说这个错误以前没有出现过，我的意思是，我运行一个笔记本没有问题，然后我尝试再次运行它，并且出现了这个错误，现在我还没有摆脱它。欢迎任何建议。
要运行笔记本，您需要指定 RTree 的版本 !pip install "rtree>=0.8,