在远程集群上运行 matlab mfile

Question

我正在 Matlab 中求解非线性偏微分方程。我的代码多次调用 fft2 和 ifft2 命令。所以我想使用集群的 GPU 来加速计算。我已经使用 gpuArray 为 gpu 准备了代码并收集。但是，我在集群使用方面非常天真，我唯一知道的是我应该使用 putty 使用 ssh 终端，并且集群上没有安装 Matlab，我的代码需要先编译。 首先我想知道我应该如何编译我的 Matlab 代码 第二，如何在这个远程集群上运行这段代码？命令是什么？

非常感谢您的帮助

Answer 1

首先，为了使用 GPU，您需要将 fft2(x) 更改为 gather(fft2(gpuArray(x)))。同样，ifft2(x) 变为 gather(ifft2(gpuArray(x)))。

假设您不是在谈论将集群用作并行计算的工作线程，您可以使用matlab -r 'myfunction' 形式的命令从 linux 终端运行 MATLAB 命令。请注意，myfunction.m 必须存在于当前工作目录或 MATLAB 的默认路径中。

修改脚本以使用 GPU 后，通过 ssh 进入集群，切换到包含脚本的目录并运行 matlab -r 命令。