调整 holoviews 散景中的颜色图以匹配值的分布答案

【问题标题】：Adjust colormap in holoviews bokeh to match distribution of values调整 holoviews 散景中的颜色图以匹配值的分布
【发布时间】：2018-12-17 06:46:02
【问题描述】：

我使用以下选项在 jupyter notebook 的 Holoviews 中创建了一张带有散景扩展的地图：

%output size=150
%opts Overlay [show_legend=True, width=800 height=400]
%opts Points.Data [color_index='b' size_index='a' scaling_factor=10 colorbar=True](cmap='RdYlGn' size=3)

“b”和“a”都是介于 -1 和 1 之间的变量。

这会产生两个问题（也比较图片）：

这些点的大小是根据变量“a”的绝对值。但是，我希望值产生更小（更大）的点，值越负（正）。任何解决方案（除了在绘图之前将“a”重新调整为正范围）？
由于“b”的正值明显多于负值，因此几乎所有点 a 都映射为绿色，而颜色范围的负值部分很少使用。我不想转换“b”，因为我希望在颜色图例中显示它的值是有意义的。有什么建议如何调整颜色图以更好地反映“b”值的分布？

我是 holoviews/bokeh 的新手，还没有习惯语法。因此，我也很欣赏示例代码。

【问题讨论】：

标签： colors bokeh color-mapping holoviews

【解决方案1】：

您的第一个问题的答案非常简单，Points 支持 size_fn 选项，您可以使用它来转换大小值，然后再绘制一些简单的东西，比如将点偏移 1 就可以了。第二个问题比较棘手，没有直截了当的答案。如果低于 0 的点很少，我会考虑发散颜色图是否是正确的选择。也许只是将颜色维度的范围设置为 0-1，使用标准颜色图并为范围之外的值设置特殊颜色。

# Make some fake data
lon, lat = np.random.rand(2, 100)*180-90
a = np.clip((np.random.randn(100) + 1)/2., -1, 1)
b = np.clip((np.random.randn(100) + 1)/2., -1, 1)
df = pd.DataFrame({'lon': lon, 'lat': lat, 'a': a, 'b': b})

gv.tile_sources.EsriImagery * gv.Points(df, ['lon', 'lat']).options(
    width=600, height=400, color_index='a', size_fn=lambda x: x+1, 
    scaling_factor=20, size_index='b', colorbar=True, cmap='Greens', 
    clipping_colors={'min': "red"}
).redim.range(a=(0, 1))

在上面的示例中，我使用size_fn 将颜色值偏移了一个，因此它们都是正数并且可以缩放。其次，我使用.redim.range 方法将颜色值的范围设置为0-1。最后我用clipping_colors 表示任何低于最小值（0）的值都应该被涂成红色。

【讨论】：

【解决方案2】：

要回答 #2，您可以使用默认颜色图制作自己的颜色图，然后像这样从颜色图的末端移除许多颜色（更改开始/停止）

from matplotlib.colors import LinearSegmentedColormap
import matplotlib.pyplot as plt
cmap_name = 'RdBu_r'
start = 0.4
stop = 1
n = 256
cmap = plt.get_cmap(cmap_name)
colors = cmap(np.linspace(start, stop, cmap.N))
new_cmap = LinearSegmentedColormap.from_list('mycmap', colors=colors, N=n)

然后做一个points = points.redim.range(data=(-0.2, 1))

例如，下面，我从 RdBu_r 中删除了所有的蓝色，只留下红色 https://holoext.readthedocs.io/en/latest/examples/changing_colorbar_cmap.html#Colorbar-string-shortcut

【讨论】：