捆绑安装 Rsruby 失败，但 Gem 安装成功答案

【问题标题】：Bundle Install Rsruby Fails, But Gem Install Succeeds捆绑安装 Rsruby 失败，但 Gem 安装成功
【发布时间】：2017-03-11 23:11:31
【问题描述】：

我有 ruby2.2，ubuntu 14.04.4 LTS，我想安装 rsruby gem。一切都设置好了，我所有的其他 gem 都设置好了，使用“sudo bundle install”。但是当我尝试这样安装时，rsruby 不断崩溃。如何调试它并使其工作？

我有一个运行此命令的脚本

sudo bundle config build.rsruby "--with-R-include=/usr/share/R/include --with_cflags=\"-fPIC -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wall -fno-strict-aliasing\""

然后我运行“sudo bundle install”，它在 RSRuby 上崩溃了：

Gem::Ext::BuildError: ERROR: Failed to build gem native extension.

/usr/bin/ruby2.2 -r ./siteconf20161028-31919-l2ks0n.rb extconf.rb
--with-R-include=/usr/share/R/include --with_cflags=\"-fPIC -g -O2
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wall
-fno-strict-aliasing\"
checking for main() in -lR... *** extconf.rb failed ***
Could not create Makefile due to some reason, probably lack of necessary
libraries and/or headers.  Check the mkmf.log file for more details.  You may
need configuration options.


from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:541:in `try_link0'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:556:in `try_link'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:735:in `try_func'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:992:in `block in find_library'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:911:in `block in checking_for'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:351:in `block (2 levels) in postpone'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:321:in `open'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:351:in `block in postpone'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:321:in `open'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:347:in `postpone'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:910:in `checking_for'
from /usr/lib/ruby/2.2.0/mkmf.rb:988:in `find_library'
from extconf.rb:15:in `<main>'

extconf failed, exit code 1

Gem files will remain installed in
/var/lib/gems/2.2.0/bundler/gems/rsruby-e72a8dc61617 for inspection.
Results logged to
/var/lib/gems/2.2.0/bundler/gems/extensions/x86_64-linux/2.2.0/rsruby-e72a8dc61617/gem_make.out

An error occurred while installing rsruby (0.5.5), and Bundler cannot
continue.

但是如果我跑了

sudo gem install rsruby -- --with-R-dir=/usr/lib/R --with-R-include=/usr/share/R/include --with_cflags="-fPIC -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wall -fno-strict-aliasing"

然后就安装成功了

Fetching: rsruby-0.5.1.1.gem (100%)
Building native extensions with: '--with-R-dir=/usr/lib/R --with-R-include=/usr/share/R/include --with_cflags=-fPIC -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wall -fno-strict-aliasing'
This could take a while...
Successfully installed rsruby-0.5.1.1
Parsing documentation for rsruby-0.5.1.1
Installing ri documentation for rsruby-0.5.1.1
Done installing documentation for rsruby after 0 seconds
1 gem installed

所以，我的问题是，我该如何调试？以及如何让它与捆绑安装一起使用？谢谢！

更新，正如 matt 在 cmets 中指出的那样，两个命令安装的 rsruby gem 的版本不同。如果我更改我的 Gemfile 以指定捆绑安装版本“0.5.1.1”，那么“sudo bundle install”安装成功。但是，我需要版本“0.5.5”。我的 Gemfile 目前是这样设置的，“gem 'rsruby', github: 'custora/rsruby'”并且必须获得 0.5.5 版本。那么为什么 0.5.1.1 会正确安装，而 0.5.5 却不能呢？

更新，mkmf.log

gcc -o conftest -I/usr/include/x86_64-linux-gnu/ruby-2.1.0 -I/usr/include/ruby-2.1.0/ruby/backward -I/usr/include/ruby-2.1.0 -I. -I/usr/share/R/include -D_FORTIFY_SOURCE=2   "-g conftest.c  -L. -L/usr/lib/x86_64-linux-gnu -L. -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -L/build/ruby2.1-3vrZnx/ruby2.1-2.1.9/debian/lib -fstack-protector -rdynamic -Wl,-export-dynamic     -lruby-2.1  -lpthread -lgmp -ldl -lcrypt -lm   -lc"
sh: 1: Syntax error: Unterminated quoted string
checked program was:
/* begin */
1: #include "ruby.h"
2:
3: int main(int argc, char **argv)
4: {
5:   return 0;
6: }
/* end */

【问题讨论】：

那些使用两个不同版本的 ruby 吗？
是的，马特，我也注意到了。所以要为正在发生的事情添加更多信息，如果我更改我的 Gemfile 以指定捆绑安装版本“0.5.1.1”，那么它“sudo bundle Install”安装成功。但是，我需要版本“0.5.5”。我的 Gemfile 目前是这样设置的，“gem 'rsruby', github: 'custora/rsruby'”并且必须获得 0.5.5 版本。那么为什么 0.5.1.1 会正确安装，而 0.5.5 却不能呢？
感谢 matt 指出这一点，帖子已用新信息更新，我仍然卡在上面，无法获得我需要安装的版本
您从哪里获得 rsruby 0.5.5 的源代码？在 github 上，我看到最终版本是 0.5.1.1，大约在五年前发布。
这是一个我正在与其他人合作的联合项目。负责人将 gemfile 设置为“gem 'rsruby', github: 'custora/rsruby'”，据我所知，这些是告诉运行该项目的服务器从哪里获取 rsruby 的唯一命令，并且当我在服务器上执行捆绑列表时，rsruby 的版本是“rsruby (0.5.5 e72a8dc)”。这是否回答你的问题？弄清楚这个问题对我来说有点新鲜。

标签： ruby ubuntu rubygems bundler

【解决方案1】：

好的，这里发生了一些不同的事情。我会将它们全部记录在这里，以防需要使用 rsruby 的其他人遇到此问题。首先，正如马特指出的那样，bundle install 和 gem install 试图安装两个不同版本的 rsruby。其次，我必须更改我运行的这个脚本来设置捆绑配置选项，这个脚本不起作用。为了完成这项工作，我将\" 替换为'

#!/bin/bash

# Does /usr/bin/gem link to /usr/bin/gem2.1 ?
# gem install bundler -v 1.6.0.rc2
sudo bundle config build.rsruby "--with-R-include=/usr/share/R/include --with-cflags=\"-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -fPIC\""

以上两步完成rsruby安装。但在那之后，我还是不断收到段错误。问题似乎是 ubuntu 的旧发行版，或者因为它是 ubuntu 的旧发行版，我不得不使用 Brightbox repo 来获取更新版本的 ruby。无论如何，在更新到具有当前 ruby 版本的当前 linux 发行版之后，它就可以工作了。

【讨论】：