在r中使用sqldf时连接数据库失败

Question

我将一个 csv 文件加载到我的 R 中，当我尝试使用 sqldf 选择某个列时，它总是转到

Error in .local(drv, ...) : 
  Failed to connect to database: Error: Access denied for user 
  'User'@'localhost' (using password: NO)
Error in !dbPreExists : invalid argument type

我不知道怎么解决。

这是我的脚本：

library("RMySQL")
library(sqldf)
acs<-read.csv("getdata_data_ss06pid.csv",head = T)
sqldf("select pwgtp1 from acs where AGEP < 50")

Answer 1

使用sqldf时似乎不需要加载RMySQL库，因为您已经将数据读入内存，这似乎是这里的问题：

library(RMySQL)
library(sqldf)
sqldf("select * from df limit 6")

.local(drv, ...) 中的错误： 连接数据库失败：错误：无法通过套接字'/tmp/mysql.sock'连接到本地MySQL服务器（2） !dbPreExists 中的错误：参数类型无效

但是，如果 RMySQL 库被分离，sqldf 可以工作：

detach("package:RMySQL", unload=TRUE)
sqldf("select * from df limit 6")
#   time  type
# 1    1 type1
# 2    2 type1
# 3    3 type2
# 4    4 type1
# 5    5 type2
# 6    6 type1

Answer 2

TL;DR

在调用sqldf函数之前，将sqldf默认驱动选项显式设置为SQLite，而不是卸载RMySql包：

options(sqldf.driver = "SQLite")
sqldf("select * from df limit 6")

说明

如果没有明确定义，sqldf 包将决定使用哪个 DB 驱动程序，如下所示：

如果未指定，则选中“dbDriver”选项，如果未指定 set then sqldf 检查 RPostgreSQL、RMySQL 或 RH2 是否是 按该顺序加载，驱动程序对应于第一个 发现被使用。如果没有加载，则使用“SQLite”。数据库名=NULL 导致使用默认值。

在您的情况下，RMySql 已经加载，sqldf 将尝试使用 MySQL 数据库并写入名为test 的模式。分离和卸载RMySQL 包是一种选择，但不是必需的。正如@GaborGrothendieck 在他的评论中提到的，最简单的解决方法是简单地告诉sqldf 明确使用哪个数据库驱动程序，即

sqldf("select * from df limit 6", drv="SQLite")

为了不必总是添加drv="SQLite"，您可以将会话的默认驱动程序永久设置为SQLite：

options(sqldf.driver = "SQLite")