匹配一行并将多个文件归为一个文件答案

【问题标题】：Match a line and cat multiple files into one file匹配一行并将多个文件归为一个文件
【发布时间】：2017-07-02 19:18:38
【问题描述】：

我有一个包含 3 列和 4426 行的文件，类似这样

文件1：

DAEQUEG00000025 FP3SLUG00002140 FOMPING00001058 
DAEQUEG00001923 FP3SLUG00002391 FOMPING00000186 
DAEQUEG00000047 FP3SLUG00002116 FOMPING00001081 
DAEQUEG00000321 FP3SLUG00006281 FOMPING00000374

我有相同数量的文件并以相同的方式命名 (DAEQUEG00000025.fa FP3SLUG00002140.fa FOMPING00001058.fa)

我想将第一行匹配到文件列表并将cat 匹配到一个文件中。

预期输出（一个文件的第一行）

>DAEQUEG00000025 ATGTTGTTTAGATTGGCCCGGCGAGCTACAAGCCCGCTCACCCGCTCGATGGCGACGCAT GCGCGAGGACTCCCTGCTCTACTCGAGAAGAAACCAGACGATGTAGTCATAACATTCGCA >FP3SLUG00002140 AAGCGTACTGCTATGGCACGCGCGAGGAAGGGTCAGCTAAAGGACATCCCTGTCGACGAG >FOMPING00001058 CTTATGCAGGCTCTCATCAAGACTCAGCTCGATCCAGCTATGCTAGAGGACATATGCGTA GGGACTTGTCACCCTCCGTCACCGACGTACATCTCTCGAGCAGCTGCTCTTGCTGCTGGA

【问题讨论】：

4426 行 和 我有相同数量的文件 表示 4426 个文件？
..你为自己尝试了什么，你在哪里失败了？
只是第一行？那你要cat一共3个文件吗？
另外，显示一些示例数据和预期输出。
@RomanPerekhrest 是的，每一行都有 3 个文件放入一个文件中

标签： awk sed grep cat

【解决方案1】：

你可以试试，

while read -r a b c; do 
    cat "$a.fa" "$b.fa" "$c.fa" > "${a}_${b}_${c}.fa"; 
done < file1

你会得到几个带有复合名称的文件作为输出，例如

DAEQUEG00000025_FP3SLUG00002140_FOMPING00001058.fa

【讨论】：