使用 sed 或 awk 从特定点删除字符直到空格之前答案

【问题标题】：Remove characters from specific point until before space using sed or awk使用 sed 或 awk 从特定点删除字符直到空格之前
【发布时间】：2018-09-22 06:55:49
【问题描述】：

我想从特定点删除字符，直到第一个空格之前（不删除空格本身）。比如我的file.txt如下：-

>DN256845_c2_g1_i1 len=56274 ACGGAGG
>DN256532_c0_g2_i19 len=23973 AATACTC
>DN256979_c8_g3_i32 len=16728 CGAAACT

'X' 是诸如 1 或 19 或 32 之类的数字，我希望它是：-

>DN256845_c2_g1 len=56274 ACGGAGG
>DN256532_c0_g2 len=23973 AATACTC
>DN256979_c8_g3 len=16728 CGAAACT

我曾使用过sed 's/_i.*//'，但它删除了_i 之后的所有内容。我尝试过的其他代码是sed 's/_i.*\./\ /g'， sed -E 's/_i.*+[^[: :]]//g' 最终没有任何改变。

如何使用 sed/awk 或任何其他方法解决此问题？我很感激帮助。谢谢！

编辑：根据 Sundeep 的建议，我编辑了问题以便于理解。这些数据实际上是 Trinity 成绩单标识符。我需要删除标识符（_i1 等）以进行一些分析）。

【问题讨论】：

标签： macos awk sed

【解决方案1】：

在 awk 中：

$ awk '{sub(/_[^_ ]+ /," ")}1' file
>DN256845_c2_gXX len=56274 ACGGAGG
>DN256532_c0_gXX len=23973 AATACTC
>DN256979_c8_gXX len=16728 CGAAACT

与sed相同：

$ sed 's/_[^_ ]\+ / /' file

将下划线的第一个实例替换为除下划线或空格之外的所有内容。

编辑：我想知道为什么我没有发布这个明显的 awk 来操纵 $1 的结尾：

$ awk '{sub(/_[^_]+$/,"",$1)}1' file

【讨论】：

或者只是sed 's/_i[^ ]*//' file（或更一般地说，sed 's/_i[^[:space:]]*//' file）
当然，TIMTOWTDI。
哇，非常感谢！现在我只是好奇它是如何工作的。
解释为斜体。
使用第一个字段的好技巧，然后它变得容易得多，例如：awk '{sub(/_i.*/,"",$1)}1' file

【解决方案2】：

'X' 是数字，例如 1 或 19 或 32

提供尽可能接近实际用例的示例是个好主意。我已将示例数据更改为将 i 之后的 X 更改为数字。如果这没有帮助，请在问题中添加更好的示例

$ cat ip.txt
>DN256845_c2_gXX_i1 len=56274 ACGGAGG
>DN256532_c0_gXX_i19 len=23973 AATACTC
>DN256979_c8_gXX_i32 len=16728 CGAAACT

$ sed 's/_i[0-9]* / /' ip.txt
>DN256845_c2_gXX len=56274 ACGGAGG
>DN256532_c0_gXX len=23973 AATACTC
>DN256979_c8_gXX len=16728 CGAAACT

_i[0-9]* 匹配 _ 后跟零个或多个数字后跟空格
用空格替换它

对于这个用例，这也可以缩短为

sed 's/_i[^ ]*//' ip.txt

【讨论】：