【发布时间】:2020-02-21 07:30:39
【问题描述】:
不幸的是,如果不将机密凭据共享给我遇到问题的数据库,我将无法为这个问题创建一个好的重现。希望我在下面有足够的信息来标记任何 ODBC 专家能够理解的明显问题。
背景
我正在运行具有以下规格的 MacBook Pro:
Model Name: MacBook Pro
Model Identifier: MacBookPro15,1
Processor Name: 6-Core Intel Core i7
Processor Speed: 2.6 GHz
Number of Processors: 1
Total Number of Cores: 6
L2 Cache (per Core): 256 KB
L3 Cache: 9 MB
Hyper-Threading Technology: Enabled
Memory: 32 GB
Boot ROM Version: 1037.0.78.0.0 (iBridge: 17.16.10572.0.0,0)
我的 ODBC 连接是使用 here 指定的 FreeTDS 设置的。
freetds.conf的相关部分如下:
# The POC SQL Server
[POC]
host = 172.22.238.154
port = 1433
tds version = 7.3
我的odbcinst.ini文件如下:
[FreeTDS]
Description=FreeTDS Driver for Linux & SQL Server
Driver=/usr/local/lib/libtdsodbc.so
Setup=/usr/local/lib/libtdsodbc.so
UsageCount=1
我的odbc.ini文件指定如下:
[POC]
Description = Connecton to Partners for our children SQL Server
Driver = FreeTDS
Servername = POC
我正在尝试使用 R 中的以下连接信息连接到 SQL Server 2012 数据库(通过 VPN):
con <- DBI::dbConnect(odbc::odbc()
,dsn = "POC"
,uid = Sys.getenv("MSSQL_UN")
,database = "CA_ODS"
,pwd = Sys.getenv("MSSQL_PW"))
这会生成以下连接对象:
> con
<OdbcConnection> POC2
Database: CA_ODS
Microsoft SQL Server Version: 11.00.7001
通常,此连接按预期工作。我可以毫无问题地使用DBI::dbGetQuery(con, "select * from MyTable")、dplyr::tbl(con, MyTable) 等查询数据库。
问题
然而,RStudio 仅显示数据库对象的每隔一个字母,并在前几个字母之后截断对象名称。下面的截图应该很好地说明了这个问题:
我尝试连接的数据库名为CA_ODS。但是,RStudio 对象浏览器仅显示数据库名称的所有其他字母(即 DB 列为 C_D)。
这似乎也不限于 RStudio本身。虽然实际数据库查询的结果如上所述工作正常,但从INFORMATION_SCHEMA 返回的名称似乎与对象浏览器中的信息匹配。下面,当直接从 SQL Server Management Studio 运行时,返回的TABLE_CATALOG 是CA_ODS,TABLE_SCHEMA 是ndacan,等等。但是,当通过数据库连接运行时,我得到以下信息。
> DBI::dbGetQuery(con, "SELECT * FROM INFORMATION_SCHEMA.TABLES WHERE
TABLE_SCHEMA='ndacan'")
TABLE_CATALOG TABLE_SCHEMA TABLE_NAME TABLE_TYPE
1 C_D naa f21v BASE TABLE
问题
关于如何在 R 或 FreeTDS 配置中重新指定我的 ODBC 连接以获取返回的数据库对象的全名的任何建议?
【问题讨论】:
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可能相关:github.com/r-dbi/odbc/issues/283。我的猜测是您的 macos 正在运行 R-3.6。似乎有两件事对某些人有用:(1)降级到 R-3.5.3; (2) 重新安装
odbc包from source(不是CRAN 二进制文件)。 -
@r2evans 这为我修复了它(即
install.packages("odbc", type = 'source')) -
如果您想提供答案,我会接受。无关(在升级到 Catalina 之前我遇到了这个问题,但 Catalina 似乎已经使用 XCode) - 我需要重新安装 XCode,然后才能从源代码安装
odbc。xcode-select --install应该为 XCode 解决问题 -
我相信你回答自己(用你所采取的步骤)会更可信:我没有 macos,只是转发第三方对话。另一方面,你做得更多。除了自我回答之外,在对原始问题 (github.com/r-dbi/odbc/issues/283) 的评论中包含您采取的额外 Xcode 步骤可能会有所帮助,因为他们仍在解决这个问题。谢谢!
标签: r sql-server odbc freetds r-dbi