无法打开 lib 'FreeTDS'：找不到文件并且 /etc/odbcinst.ini 丢失

Question

我想将 R 连接到 AWS 中的 Athena，这样我就可以从数据库中获取一个表到 R 中。所以我上网搜索了如何做到这一点。我找到了这个网站here。那告诉我我需要安装驱动程序。我有一个mac（这对我来说也是新的），我在website 的mac 部分下发现我需要安装我所做的自制软件。然后我在终端中执行了这些后续步骤。

1. 安装所有数据库都需要的UnixODBC

   brew 安装 unixodbc

2. 安装常用数据库驱动程序（可选）

   brew install freetds --with-unixodbc

   brew 安装 psqlodbc

我通常不在终端工作。所以我对它不太熟悉。无论如何，我认为这样做了，所以我运行了以下代码。

con <- DBI::dbConnect(
  odbc::odbc(),
  Driver             = "FreeTDS",
  S3OutputLocation   = " etc..",
  AwsRegion          = "etc..",
  AuthenticationType = "...",
  Schema             = "...",
  UID                = rstudioapi::askForPassword("AWS Access Key"),
  PWD                = rstudioapi::askForPassword("AWS Secret Key")
  )

当我运行此代码时，出现以下错误：

Error: nanodbc/nanodbc.cpp:983: 00000: [unixODBC][Driver Manager]Can't open lib 'FreeTDS' : file not found 

当然，我用谷歌搜索了这个错误，并在堆栈交换上发现了一些有趣的东西。虽然我得到了这些回复，但在终端玩了之后：

sudo Rscript -e 'odbc::odbcListDrivers()'
[1] name      attribute value    
<0 Zeilen> (oder row.names mit Länge 0)

显示零行和长度为 0 的 row.names。

我也跑过这个

cp /etc/odbcinst.ini ~/.odbcinst.ini && Rscript -e 'odbc::odbcListDrivers()

我明白了

cmdand quote> '
cp: /etc/odbcinst.ini: No such file or directory

我不明白为什么会这样，因为我完成了第一步和第二步。

Answer 1

这是对@FlipperPA 前面提到的内容的扩展。 s3_staging_dir 是 AWS Athena 输出结果的 AWS S3 存储桶。默认情况下，RAthena 尝试通过删除即席查询结果来保持整洁。但是，这可以通过使用查询缓存 (https://dyfanjones.github.io/RAthena/articles/aws_athena_query_caching.html) 来阻止。

如果您想获取查询的 AWS S3 路径，您可以执行以下操作：

library(DBI)

# connect to AWS Athena, credentials are stored in:
# .aws/credentials or environmental variables
con <- dbConnect(RAthena::athena(), s3_staging_dir="s3://athena/output/")

# Start caching queries
RAthena_options(cache_size = 10)

# Execute a query on AWS Athena
res <- dbExecuteQuery(con,  "select * from sampledb.elb_logs")

# AWS S3 Location of query
sprintf("%s%s.csv",res@connection@info$s3_staging, res@info$QueryExecutionId)

链接的stackoverflow问题：Can you use Athena ODBC/JDBC to return the S3 location of results?