如何使用 heroku 的 webapp-runner.jar 运行 cbioportal tomcat 战争

Question

我一直在学习 Heroku (https://devcenter.heroku.com/articles/java-webapp-runner) 的教程，学习如何使用 webapp-runner.jar 运行 war 文件。现在我想在 heroku 上运行 cbioportal (https://github.com/cbioportal/cbioportal)。我已经设法将 webapp-runner.jar 添加为依赖项，请参阅：https://github.com/inodb/cbioportal/tree/heroku。

当我从 repo 目录运行以下命令时：

java -Djava.naming.factory.initial=org.apache.naming.java.javaURLContextFactory \
    -jar portal/target/dependency/webapp-runner.jar --port 9099 portal/target/portal

我收到这样的错误：

SEVERE: Exception sending context initialized event to listener instance of class org.springframework.web.context.ContextLoaderListener
org.springframework.beans.factory.BeanCreationException: Error creating bean with name 'entityMapper' defined in class path resource [applicationContext-business.xml]: Cannot resolve reference to bean 'sqlSessionFactory' while setting bean property 'sqlSessionFactory'; nested exception is org.springframework.beans.factory.BeanCreationException: Error creating bean with name 'sqlSessionFactory' defined in class path resource [applicationContext-business.xml]: Cannot resolve reference to bean 'businessDataSource' while setting bean property 'dataSource'; nested exception is org.springframework.beans.factory.BeanCreationException: Error creating bean with name 'businessDataSource' defined in class path resource [applicationContext-business.xml]: Invocation of init method failed; nested exception is javax.naming.NameNotFoundException: Name [java:comp/env/jdbc/mydb] is not bound in this Context. Unable to find [java:comp].

我尝试传递本地 Tomcat 安装的 context.xml 并直接在文件中设置 mysql 连接字符串，但无济于事。

Answer 1

我认为您需要将 DB URL 注册为 context.xml 文件中的 JNDI 资源，可能像这样：

<Context>
  <Resource name="jdbc/cbioportal" auth="Container" type="javax.sql.DataSource"
               maxTotal="100" maxIdle="30" maxWaitMillis="10000"
               username="user" password="pass" driverClassName="com.mysql.jdbc.Driver"
               url="jdbc:mysql://localhost:3306/dbname"/>
</Context>

然后您需要将该上下文 XML 作为选项添加到 java 命令中，如下所示：

$ java ... \
    -jar portal/target/dependency/webapp-runner.jar \
    --context-xml context.xml --port 9099 \
    portal/target/portal

对于context.xml 中的url，您必须从$ heroku config 中获取它并将其转换为jdbc url。它在运行时以$JDBC_DATABASE_URL 的形式提供，但我不确定如何动态地将其放入 context.xml。

因此，我认为如果可能，最好不要使用 JNDI。您可以直接在您的应用程序中配置数据库参数吗？

我从 this line in your config 获得了 JNDI 名称

有关 JNDI 与 Tomcat 的更多信息，请参阅the Tomcat docs。

有关 webapp-runner 选项的更多信息，请参阅project readme。