如何在 R 中使用 system() 或 shell() 执行 git-bash 命令

【问题标题】：How to execute git-bash command with system() or shell() in R如何在 R 中使用 system() 或 shell() 执行 git-bash 命令
【发布时间】：2019-09-27 21:21:42
【问题描述】：

我想通过 R 中的 system() 或 shell() 函数在 git-bash shell 中运行一些命令。我在 Windows 上，默认 shell 是命令提示符。有什么办法可以将system() 中的shell 切换为git-bash？

谢谢

【问题讨论】：

我不确定我是否理解。我在带有 git-bash 的 Windows 上，system('"/Program Files/Git/usr/bin/ls.exe"') 无需更改任何内容即可专门使用 git-bash。也许您需要更新您的PATH env-var？你在尝试什么不起作用？
在 RStudio 中使用终端选项卡时，我的 git 凭据在 git-bash 中工作正常（git-bash 是我在终端选项卡中的默认 shell）。但是，当我在system() 中尝试git clone git@github.com:someuser/somefolder 时，它无法识别我的凭据。我知道我也可以在命令提示符下设置我的凭据，但我不想这样做。

标签： r git-bash

【解决方案1】：

如果你的%PATH%包含C:\Program Files (x86)\Git\bin\，你应该可以系统调用：

bash --login -i -c "your command"

OP JdeMello 确认in the comments：

是的：PATH 中没有 C:\Program Files\Git\bin。

为了补全，我们可以在R的PATH中添加Git\bin（如果需要的话）：
if(length(grep("(?i)Git//bin", Sys.getenv("PATH"))) == 0) 
    Sys.setenv(PATH=paste0(Sys.getenv("PATH"),";C://Program Files//Git//bin")) 
这对我有用。

【讨论】：

是的。 PATH 中没有 C:\Program Files\Git\bin。为了完成，我们可以在R中添加Git\bin到PATH（如果需要）：if(length(grep("(?i)Git//bin", Sys.getenv("PATH"))) == 0) Sys.setenv(PATH=paste0(Sys.getenv("PATH"),";C://Program Files//Git//bin")) 。这对我有用。谢谢@VonC！
@JdeMello 感谢您的反馈。我已将您的评论包含在答案中以提高知名度。