使用 R Markdown 样式文档 (.Rmd) 作为 Pweave 的输入答案

【问题标题】：Using an R Markdown style document (.Rmd) as input for Pweave使用 R Markdown 样式文档 (.Rmd) 作为 Pweave 的输入
【发布时间】：2016-10-28 15:01:03
【问题描述】：

我正在尝试通过Pweave 运行一个基本的 R Markdown 文档（在代码块中调用 python）。在Pweave documentation 中声明您可以使用```{python} 样式声明代码块。但是，当我尝试使用例如pweave -f pandoc FIR_design.mdw 进行编译时，块不会运行，而是逐字放置。

所有examples in the documentation 都使用noweb 语法，例如

<<fig = True, width = '12 cm', echo = False>>=
from pylab import *
plot(arange(10))
show()
@

降价等价物是：

```{python, fig = True, width = '12 cm', echo = False}
from pylab import *
plot(arange(10))
show()
```

当我尝试使用 markdown 语法运行示例时，它只是逐字添加它们并且不运行块。这是预期的吗？如果是这样，我应该如何转换我的.Rmd 文档以使它们可以在Pweave 中运行。我必须将它们转换为noweb 样式吗？

这里是文档示例文档FIR_design.mdw重写为.Rmd格式（例如）：

FIR_design.Rmd

【问题讨论】：

noweb 样式有效吗？
确实如此。示例 .mdw here 与 pweave -f pandoc FIR_design.mdw 一起运行良好。我已经对解决问题的以下解决方案进行了编辑。给定一个.Rmd 文件，使用pweave -i markdown <source>.Rmd。

标签： python markdown r-markdown pweave

【解决方案1】：

尝试使用pweave -i markdown <source>，而不是pweave -f pandoc <source>。

如果不提供输入格式，则为deduced from file extension。正如您在链接源中看到的那样，您的输入文件需要具有 .md 扩展名才能自动检测为“Pandoc markdown”格式。

默认输出格式似乎与输入相同，或与--format (-f) 提供的一样。

【讨论】：