R 写作风格 - 要求 vs. ::答案

【问题标题】：R writing style - require vs. ::R 写作风格 - 要求 vs. ::
【发布时间】：2011-05-21 07:19:07
【问题描述】：

好的，我们都熟悉R中的双冒号运算符。每当我要编写一些函数时，我都会使用require(<pkgname>)，但我一直在考虑使用::。在自定义函数中使用require 比library 更好，因为require 返回警告和FALSE，不像library，如果你提供一个不存在的包的名称会返回错误。

另一方面，:: 运算符从包中获取变量，而require 加载整个包（至少我希望如此），所以我首先想到的是速度差异。 :: 必须比 require 快。

我做了一些分析以检查 - 我编写了两个简单的函数，从 foreign 包加载 read.systat 函数，分别使用 require 和 ::，因此导入 Iris.syd 数据集附带 foreign 包，每个函数复制 1000 次（这是无耻的任意），并且...计算了一些数字。

奇怪的是（或不是）我发现在用户 CPU 和运行时间方面存在显着差异，而在系统 CPU 方面没有显着差异。还有更奇怪的结论：:: 实际上更慢！ :: 的文档非常生硬，仅通过查看来源就可以明显看出 :: 的性能应该更好！

要求

#!/usr/local/bin/r

## with require
fn1 <- function() {
  require(foreign)
  read.systat("Iris.syd", to.data.frame=TRUE)
}

## times
n <- 1e3

sink("require.txt")
print(t(replicate(n, system.time(fn1()))))
sink()

双冒号

#!/usr/local/bin/r

## with ::
fn2 <- function() {
  foreign::read.systat("Iris.syd", to.data.frame=TRUE)
}

## times
n <- 1e3


sink("double_colon.txt")
print(t(replicate(n, system.time(fn2()))))
sink()

获取 CSV 数据 here。一些统计数据：

user CPU:     W = 475366    p-value = 0.04738  MRr =  975.866    MRc = 1025.134
system CPU:   W = 503312.5  p-value = 0.7305   MRr = 1003.8125   MRc =  997.1875
elapsed time: W = 403299.5  p-value < 2.2e-16  MRr =  903.7995   MRc = 1097.2005

MRr 是require 的平均排名，MRc 同上::。我一定在这里做错了什么。它只是没有任何意义......:: 的执行时间似乎更快！我可能搞砸了，你不应该放弃那个选项......

好吧...我浪费了我的时间来看看有什么不同，我进行了完全无用的分析，所以，回到问题：

“为什么在编写函数时应该更喜欢require 而不是::？”

【问题讨论】：

这是针对独立函数还是包中的函数？
另外，您通常会在脚本顶部使用一次 require()，而不是在每个函数调用中都使用一次。
用于独立功能。我正在开发一个 Web 应用程序，并且由于 RApache 在每个 HTTP 请求时都会启动新的 R 会话，因此我试图避免不必要的服务器负载。这个例子是不合适的——一旦你导入一个文件，工作就完成了，但是在一个带有一堆 AJAX 调用的交互式 webapp 中，这可能是非常低效的。

标签： r namespaces packages

【解决方案1】：

"为什么人们更喜欢 require 而不是 :: 写函数的时候？”

我通常更喜欢require，因为它有很好的 TRUE/FALSE 返回值，这让我可以在进入代码之前处理包不可用的可能性。尽早崩溃，而不是进行到一半的分析。

当我需要确保我使用的是正确版本的函数，而不是来自其他包中的掩盖名称的版本时，我只使用::。

另一方面，:: 运算符得到包中的变量，而需要加载整个包（至少我希望如此），所以速度差异来了我首先想到的。 :: 必须更快超过要求。

我认为您可能忽略了foreign 包根据the first page of its manual 使用的延迟加载 的影响。本质上，使用延迟加载的包会延迟对象（例如函数）的加载，直到对象第一次被调用。因此，您关于“:: 必须比要求快”的论点不一定正确，因为当您使用require 附加它时，foreign 并未将其所有内容加载到内存中。有关延迟加载的完整详细信息，请参阅 RNews 第 4 卷第 2 期中的Prof. Ripley's article。

【讨论】：

你说的太对了……这可能是依赖包的问题。哦，谢谢你的参考。

【解决方案2】：

由于与您试图弄清楚六个月前编写的代码内容所花费的时间相比，加载一个包的时间几乎总是很短，因此在这种情况下，为了清晰而编码是最重要的。

对于脚本，在开始时调用require 或library 可以让您立即知道需要哪些包。

同样，在函数开头调用require（或Hmisc 中的requirePackage 或ggplot2 中的try_require 之类的包装器）是表明您需要使用该包的最明确的方式.

:: 应保留用于包之间存在命名冲突的情况 - 比较，例如，

Hmisc::is.discrete

和

plyr::is.discrete

【讨论】：