RWeka read.arff 问题答案

【问题标题】：RWeka read.arff issuesRWeka read.arff 问题
【发布时间】：2012-01-31 04:01:25
【问题描述】：

我正在使用 RWeka 包的 read.arff 方法读取（稀疏）arff。但是我收到以下错误：

Error in .jnew("java/io/FileReader", file) : 
  java.io.FileNotFoundException:  (No such file or directory)

我尝试读取的文件存在（file.exists('myfile.arff') 返回 TRUE）。

我的一行代码是：

data = read.arff(system.file('arff', 'myfile.arff', package='RWeka'))

有什么想法吗？

谢谢。

编辑 1：traceback() 输出

> traceback()
4: stop(list(message = "java.io.FileNotFoundException:  (No such file or directory)", 
   call = .jnew("java/io/FileReader", file), jobj = <S4 object of class "jobjRef">))
3: .External("RcreateObject", class, ..., silent = silent, PACKAGE = "rJava")
2: .jnew("java/io/FileReader", file)
1: read.arff(system.file("arff", "/home/andy/r/myfile.arff", 
   package = "RWeka"))

【问题讨论】：

我会 (1) 验证文件确实存在，并且 (2) 尝试将文件的完整路径直接传递给 read.arff。这些步骤可能会为您提供有关正在发生的事情的更多信息。
我已经做了 1 个（使用 file.exists），正如我在上面发布的那样。我也通过了完整的路径。结果相同。
感谢您对我的包容……遗憾的是，这就是我将提供的帮助的程度。对不起！
traceback() 有什么有用的吗？
@RomanLuštrik ：刚刚用 traceback() 的输出编辑了我的问题。不知道该怎么做。我是 R 新手。

标签： r weka arff

【解决方案1】：

您似乎在使用help(read.arff) 中示例的格式，但不明白为什么它是使用 system.file() 函数编写的。如果您的 .arff 文件不在包目录中（并且它似乎不在此位置），那么您不应该使用该功能。试试吧：

mydat <- read.arff(file= "/home/andy/r/myfile.arff")

或者，如果它在您的工作目录中，也许只是这样：

mydat <- read.arff(file= "myfile.arff")

【讨论】：

是的，确实如此。 R 现在正在读取 ARFF，但它似乎非常缓慢且消耗内存。 WEKA 在
只是想补充一点，这可能是因为 read.arff 试图将稀疏数据读入数据帧，这可能是瓶颈。正确的？如果是这样，我可以直接将其读入稀疏数据结构吗？
我不了解您的效率问题。甚至不清楚您的流程是否已完成上述内容。
是的，我不得不在 1/2 小时后终止任务，因为很明显它无处可去。不过感谢您的帮助。
我查看了 "foreign" 包中 read.arff 函数中的代码，发现它有所不同，所以也许您可以尝试一下。（但在我的 rhelp 版主角色中，我刚刚批准了你在 r-help 上的帖子，说你已经考虑过了。）