【问题标题】:At what part does the iris data receive a labeled cluster?虹膜数据在哪一部分接收到标记的集群?
【发布时间】:2016-04-25 08:41:40
【问题描述】:

我将使用 sklearn 为我与我公司的一个项目聚集数据。对于开始部分,我必须证明我能够对数据进行聚类。在 R 中,这对我来说没问题,但是 R 与 HBase 一起使用并不那么容易。我不想拖延,但问题是我不知道数据点在什么时候收到标签。另外,这是一个 3D 图,那么为什么 X (iris.data) 每个数据点有 4 个数字 ([ 5.4 3.9 1.3 0.4])?

我真正需要的是知道哪个数据点对应于哪个集群。我不需要视觉效果。

这是代码(来自here

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D


from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn import datasets

np.random.seed(5)

centers = [[1, 1], [-1, -1], [1, -1]]
iris = datasets.load_iris()
X = iris.data
y = iris.target

estimators = {'k_means_iris_3': KMeans(n_clusters=3),
              'k_means_iris_8': KMeans(n_clusters=8),
              'k_means_iris_bad_init': KMeans(n_clusters=3, n_init=1,
                                              init='random')}


fignum = 1
for name, est in estimators.items():
    fig = plt.figure(fignum, figsize=(4, 3))
    plt.clf()
    ax = Axes3D(fig, rect=[0, 0, .95, 1], elev=48, azim=134)

    plt.cla()
    est.fit(X)
    labels = est.labels_

    ax.scatter(X[:, 3], X[:, 0], X[:, 2], c=labels.astype(np.float))

    ax.w_xaxis.set_ticklabels([])
    ax.w_yaxis.set_ticklabels([])
    ax.w_zaxis.set_ticklabels([])
    ax.set_xlabel('Petal width')
    ax.set_ylabel('Sepal length')
    ax.set_zlabel('Petal length')
    fignum = fignum + 1

# Plot the ground truth
fig = plt.figure(fignum, figsize=(4, 3))
plt.clf()
ax = Axes3D(fig, rect=[0, 0, .95, 1], elev=48, azim=134)

plt.cla()

for name, label in [('Setosa', 0),
                    ('Versicolour', 1),
                    ('Virginica', 2)]:
    ax.text3D(X[y == label, 3].mean(),
              X[y == label, 0].mean() + 1.5,
              X[y == label, 2].mean(), name,
              horizontalalignment='center',
              bbox=dict(alpha=.5, edgecolor='w', facecolor='w'))
# Reorder the labels to have colors matching the cluster results
y = np.choose(y, [1, 2, 0]).astype(np.float)
ax.scatter(X[:, 3], X[:, 0], X[:, 2], c=y)

ax.w_xaxis.set_ticklabels([])
ax.w_yaxis.set_ticklabels([])
ax.w_zaxis.set_ticklabels([])
ax.set_xlabel('Petal width')
ax.set_ylabel('Sepal length')
ax.set_zlabel('Petal length')
plt.show()

【问题讨论】:

    标签: python scikit-learn k-means


    【解决方案1】:

    标签

    这是在您的代码中添加两个print 语句的结果,它会在生成标签时向您显示。

    for name, est in estimators.items():
        print est
        fig = plt.figure(fignum, figsize=(4, 3))
        plt.clf()
        ax = Axes3D(fig, rect=[0, 0, .95, 1], elev=48, azim=134)
    
        plt.cla()
        est.fit(X)
        labels = est.labels_
        print labels
    

    est 显示所使用的估计器的参数。如您所见,第一个有 8 个集群,反映在 labels 中的 0-7 个集群分配。

    KMeans(copy_x=True, init='k-means++', max_iter=300, n_clusters=8, n_init=10,
        n_jobs=1, precompute_distances=True, random_state=None, tol=0.0001,
        verbose=0)
    [1 5 5 5 1 1 5 1 5 5 1 5 5 5 1 1 1 1 1 1 1 1 5 1 5 5 1 1 1 5 5 1 1 1 5 5 1
     5 5 1 1 5 5 1 1 5 1 5 1 5 2 2 2 7 2 7 2 6 2 7 6 7 7 2 7 2 7 7 2 7 4 7 4 2
     2 2 2 2 2 7 7 7 7 4 7 2 2 2 7 7 7 2 7 6 7 7 7 2 6 7 0 4 3 0 0 3 7 3 0 3 0
     4 0 4 4 0 0 3 3 4 0 4 3 4 0 3 4 4 0 3 3 3 0 4 4 3 0 0 4 0 0 0 4 0 0 0 4 0
     0 4]
    KMeans(copy_x=True, init='k-means++', max_iter=300, n_clusters=3, n_init=10,
        n_jobs=1, precompute_distances=True, random_state=None, tol=0.0001,
        verbose=0)
    [0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
     0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2
     2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1
     1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1
     1 2]
    KMeans(copy_x=True, init='random', max_iter=300, n_clusters=3, n_init=1,
        n_jobs=1, precompute_distances=True, random_state=None, tol=0.0001,
        verbose=0)
    [0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
     0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
     1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2
     2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2
     2 1]
    

    尺寸

    iris 数据集有 4 个维度(属性),如果您查看 here,您会看到有 4 个维度。在此示例中您未绘制的一维是 Sepal Width。您可以通过将print iris 放在iris = datasets.load_iris() 之后来查看每个数据点对应的内容。它打印出很多信息,但重要的信息在底部(顺便说一下,不是那么漂亮)。看起来像这样-

    :Attribute Information:\n        - sepal length in cm\n        - sepal width in cm\n        - petal length in cm\n        - petal width in cm
    

    属性对应X[flower][0], X[flower][1], X[flower][2], X[flower][3]。

    作业

    要查看每个数据点的集群分配,请在labels = est.labels_ 正下方添加:

    for flower in range(len(labels)):
            print (X[flower],labels[flower])
    

    将为您提供以下结果,仅显示一种访问数据点集群分配的方法,您可能不关心打印它们,而是将它们存储在有意义的地方。

    (array([ 5.1,  3.5,  1.4,  0.2]), 1)
    (array([ 4.9,  3. ,  1.4,  0.2]), 5)
    (array([ 4.7,  3.2,  1.3,  0.2]), 5)
    

    【讨论】:

    • 非常感谢您的回复。绝对值得一试。
    • 那么如果唯一的属性是Petal WidthPetal LengthSepal Width,那么数据点对应的是什么?我所说的数据点是指这 4 个点-(array([ 5.1, 3.5, 1.4, 0.2])
    • 在解释器中执行此操作:在您之后 iris = load_iris() 然后 print iris。它将向您显示数据集的详细描述。每个数据点列都是对应于iris['feature_names'] 的测量值。在您的示例记录中:sepal length (cm) = 5.1sepal width (cm) = 3.5petal length (cm) = 1.4petal width = 0.2。 HTH
    • 谢谢。你是 cmets 非常有帮助,我希望我能做更多的事情来提高你的声誉。我所能做的就是建议看到这个页面的人给你投票。不过,您可能需要考虑将您的 cmets 放入答案中。也许我会为你做,但我现在很忙。再次感谢。
    • 感谢您的编辑,很高兴回答对您有所帮助,sci-kit tutorials 做得非常好,并且很容易在 ipython 中跟随,强烈推荐!
    猜你喜欢
    • 1970-01-01
    • 2018-09-13
    • 1970-01-01
    • 2021-12-17
    • 2020-06-11
    • 2021-09-26
    • 2013-04-29
    • 2018-04-21
    • 2020-10-05
    相关资源
    最近更新 更多