pygraphviz 1.5 默认边缘没有箭头？答案

【问题标题】：pygraphviz 1.5 default edge no arrow?pygraphviz 1.5 默认边缘没有箭头？
【发布时间】：2019-08-07 08:04:18
【问题描述】：

我已经使用这个轮子更新到 pygraphviz 1.5 Installing pygraphviz on Windows 10 64-bit, Python 3.6。

我遇到了问题。

import pygraphviz as pgv

G = pgv.AGraph()

G.add_node('a')
G.add_node('b')
G.add_edge('a', 'b')
g_string = G.string()

print(g_string)

给我

strict digraph {
    a -- b;
}

虽然之前版本 1.3 上运行的相同代码给了我

strict digraph {
    a -> b;
}

我也试过了

G.add_edge('a', 'b', arrowhead="normal") 给出a -- b [arrowhead=normal]; 但绘制时没有箭头。

我正在运行graphviz 2.38。 pygraphviz 1.3 在 python 2.7 上。 pygraphviz 1.5 在 python 3.6 上。

【问题讨论】：

标签： python graphviz pygraphviz

【解决方案1】：

我想首先指出，为了使这个示例能够正常工作，仅仅安装 PyGraphviz 模块是不够的（检查[SO]: Installing pygraphviz on Windows 10 64-bit, Python 3.6 (@CristiFati's answer)），但是Graphviz 版本也是必需的，因为 PyGraphviz 使用其中一种工具（称为 nop）。
它可供下载，无论如何我选择构建它（对于 32 位，但这不相关）。

另外，我用 2 个 .whls 进行了测试：

一个（我已经）为 Python 3.6（64 位）构建
为 Python 2.7（64 位）构建的一个

由于我有可能不得不修改它们（出于调试目的），我没有pip install它们，而是将它们解压缩到 cwd 中（这需要一些额外的代码）：

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> dir /b
code00.py
pygraphviz131_27
pygraphviz15_36

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> tree /a
Folder PATH listing for volume Work
Volume serial number is 3655-6FED
E:.
+---pygraphviz131_27
|   \---pygraphviz
|       \---tests
\---pygraphviz15_36
    \---pygraphviz
        \---tests

code00.py：

#!/usr/bin/env python3

import sys


# @TODO - cfati: The 5 lines below are because I unpacked the 2 `.whl`s in the current dir, instead of `pip install`ing them
maj, min = sys.version_info[:2]
if maj == 3 and min == 6:
    sys.path.insert(0, "pygraphviz15_36")
elif maj == 2 and min == 7:
    sys.path.insert(0, "pygraphviz131_27")
# @TODO end

import pygraphviz as pgv


def main():
    print(pgv)
    g = pgv.AGraph(directed=len(sys.argv) > 1)
    g.add_node("a")
    g.add_node("b")
    g.add_edge("a", "b")
    #print(dir(g))
    g_string = g.string()  # Nice var name, btw :)
    print(g_string)


if __name__ == "__main__":
    print("Python {:s} on {:s}\n".format(sys.version, sys.platform))
    main()

输出：

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> set PATH=%PATH%;e:\Work\Dev\Fati\WinBuild\graphviz\src\graphviz\Release\Graphviz\bin

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_02.07.15_test0\Scripts\python.exe" code00.py
Python 2.7.15 (v2.7.15:ca079a3ea3, Apr 30 2018, 16:30:26) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)] on win32

<module 'pygraphviz' from 'pygraphviz131_27\pygraphviz\__init__.pyc'>
strict digraph {
        a -> b;
}


[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_03.06.08_test0\Scripts\python.exe" code00.py
Python 3.6.8 (tags/v3.6.8:3c6b436a57, Dec 24 2018, 00:16:47) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)] on win32

<module 'pygraphviz' from 'pygraphviz15_36\\pygraphviz\\__init__.py'>
strict graph "" {
        a -- b;
}

正如所见，问题很容易重现。现在，输出 -- vs. -> 看起来 非常糟糕很多关于我如何表示无向 vs. 有向图边。我查看了源代码，发现了一些奇怪的东西。

[GitHub.PyGraphviz 1.5]: class AGraph(thing=None, filename=None, data=None, string=None, handle=None, name='', strict=True, directed=False, **attr) 具有 directed=False 参数。将其设置为 True，解决了问题。

输出：

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_02.07.15_test0\Scripts\python.exe" code00.py dummy_arg
Python 2.7.15 (v2.7.15:ca079a3ea3, Apr 30 2018, 16:30:26) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)] on win32

<module 'pygraphviz' from 'pygraphviz131_27\pygraphviz\__init__.pyc'>
strict digraph {
        a -> b;
}


[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_03.06.08_test0\Scripts\python.exe" code00.py dummy_arg
Python 3.6.8 (tags/v3.6.8:3c6b436a57, Dec 24 2018, 00:16:47) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)] on win32

<module 'pygraphviz' from 'pygraphviz15_36\\pygraphviz\\__init__.py'>
strict digraph "" {
        a -> b;
}

我说我发现了一些奇怪的东西：嗯，对于 PyGraphviz 1.3.1 事情是一样的：directed=False（代码和 doc），但它以某种方式初始化图按照它的指示。
对 agraph.py 的快速检查（在 2 个软件包版本上）并未揭示这种差异的来源，因此我可以放心地假设这是因为 Graphviz 构建 2 个 PyGraphviz 版本的软件包版本。

尽管如此，PyGraphviz 1.5（由我构建）行为是正确的。

【讨论】：

不客气！我已经了解了 PyGraphviz。我将不得不更新另一个问题，包括一些（我猜大部分）场景也需要 Graphviz 的事实。另外，我更改了 GitHub 存储库名称，目前正在编辑其他问题，完成后将包含最新信息。

【解决方案2】：

作为文档state，默认情况下 AGraph 是无向的。您必须在图形构建期间指定 directed=True 属性：

>>> G = pgv.AGraph(directed=True)
>>> G.add_node('a')
>>> G.add_node('b')
>>> G.add_edge('a', 'b')
>>> g_string = G.string()
>>>
>>> print(g_string)
strict digraph "" {
    a -> b;
}

【讨论】：