具有重要性的随机森林问题

Question

我正在尝试为生态数据构建一个随机森林，但不断收到错误

"没有适用于类对象的“重要性”方法 “逻辑”。

我的代码是：

fit2 <- randomForest(sv ~ salinity + temp + Depthbin +  cdistance + oxygen + 
                      type + diel, data=d.omit, importance(TRUE), ntree=2000)

感兴趣的变量 (sv) 是连续的，所以我不确定这是否会影响事情。当我删除代码的importance(TRUE) 部分时，我可以运行随机森林，但我获得的 IncNodePurity 值高得离谱（有些值超过 100,000 ！！）。我希望 importance(TRUE) 的添加可以解决这个问题，但如果没有，有没有人知道检查每个变量重要性的更好方法？

Answer 1

试试这个：

fit2 <- randomForest(sv ~ salinity + temp + Depthbin + cdistance + oxygen + type + diel, data=d.omit, importance=TRUE, ntree=2000)

使用importance(fit2)，您应该能够看到变量的重要性。