【问题标题】：Kmeans clustering error: Issue plotting the clustersKmeans 聚类错误：绘制聚类的问题
【发布时间】：2020-02-04 00:30:55
【问题描述】：

我正在从之前创建的数据帧中读取数据。我必须从我的数据框中选择一些向量来完成这项任务。但是，当我重新调整我的数据框对象时，它变成了“双”（而不是“列表”）。

我可以成功地对数据进行聚类，但我无法绘制它。

但我无法在简单的 2D 图中绘制它，因为我收到以下错误：

错误：data 必须是数据框，或其他可被fortify() 强制转换的对象，而不是列表

我也尝试使用 as.list 来转换 ilpd_df2 以将其从“double”转换回“list”，但它仍然没有绘图。

#Task 2.1 - Load Preprocessed Data and Subset Data as directed
    ilpd_df <- readRDS(file="ilpd_preprocessed.Rda")
    ilpd_df1 <-
    select(ilpd_df,"TB","DB","Alkphos","Sgpt","Sgot","TP","Albumin")

#Task 2.2 - Re-Scaling
    ilpd_df2 <- apply(ilpd_df1, MARGIN = 2, FUN=function(X) 
    (X - min(X))/diff(range(X)))

#Task 2.3 - Cluster the Data into 2 Clusters
    set.seed(44)
    ilpd_clusters <- kmeans(ilpd_df2, 2, nstart = 25, iter.max=5)
    ggplot(ilpd_df2, aes(Alkphos, TP)) + geom_point()


Error: `data` must be a data frame, or other object coercible by `fortify()`, not a list

【问题讨论】：

ggplot(data = ilpd_df2) + geom_point(aes(Alkphos, TP, color = ilpd_clusters$clusters))
看起来您正在使用 dplyr::select()。这将产生一个 tibble 而不是数据框，因此您需要将其强制转换为数据框。
嗨@Dij，我试过你的，但它不起作用=(
嗨@Elin，哦，好吧，因为我对 R 比较陌生，所以我不知道 tibbles。
@Elin，所以我将它强制转换为数据框，它可以工作！我做了以下 ilpd_df2

标签： r cluster-analysis data-mining k-means

【解决方案1】：

@Elin 向我指出了我的错误，他提出了以下建议：

1) 使用 dplyr::select() 会产生一个 tibble。 2) 将 tibble 强制转换为数据框

根据我自己的理解和@Elin 的指导，我做了以下事情：

将 tibble 更改为数据框

ilpd_df2 <- as.data.frame(ilpd_df2)

然后我运行代码并生成了以下图：

【讨论】：

你应该接受你自己的答案。如果您尝试在 tidyverse 之外使用 tidyverse 结构，您会经常遇到这个问题。