dgTMatrix 导出到 csv答案

【问题标题】：dgTMatrix export to csvdgTMatrix 导出到 csv
【发布时间】：2017-11-17 04:11:24
【问题描述】：

我正在处理生物信息学数据，到目前为止，我在一个大型 dgTMatrix 中生成的对象，我试图将其导出到一个 csv 文件中，无论大小如何，我都可以打开并检查它。

我正在使用 R，当我写这行时

write.csv(A.data, "Adata.csv")

我收到以下错误：

as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE) 中的错误：无法将类“structure("dgTMatrix", package = "Matrix")" 强制转换为 data.frame

据我了解，dgTMatrix 可能无法直接转换为经典表格，但我找不到需要执行哪些额外步骤才能最终获得我的 csv 文件。

任何帮助和指点将不胜感激！

【问题讨论】：

标签： r csv

【解决方案1】：

如果A.data 是一个稀疏矩阵，意思是一个对象，使得class()returns

class(A.data)
#[1] "dgTMatrix"
#attr(,"package")
#[1] "Matrix"

那么在使用write.csv2 写入磁盘之前，您需要将其强制转换为"matrix" 类或"data.frame" 类。

A.data<-as.matrix(A.data)
write.csv2(A.data, "Adata.csv")

【讨论】：

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