导入模块时 scipy.stats 丢失

Question

只有当我通过 Linux 命令行（即 Linux 的 Windows 子系统）运行代码时才会出现问题。在 Windows 上通过 conda 环境运行时不会发生这种情况。在这两种情况下，scipy 都已正确安装。

我创建了一个函数来对来自两个数据框 df_1 和 df_2 的行中的值执行线性回归。它们的列名与字典data_dict的键相同。

from scipy.stats import linregress
import numpy as np

def foo(df_1, df_2, data_dict):
    for index, row in df_2.iterrows():
        x = []
        for d in data_dict:
            x.append(row[d])
        x = np.array(x)
    for index, row in df_1.iterrows():
        y = []
        for d in data_dict:
            y.append(row[d])
        y = np.array(y)
        s, i, r, p, se = linregress(x, y)

只要我从编写它的脚本中运行它，它就可以正常工作，但是一旦我将它导入另一个脚本“bar”并尝试运行它，我就会收到错误AttributeError: module 'scipy' has no attribute 'stats'，并且回溯指的是实际使用linregress 的行，而不是导入行。

我尝试过以其他方式导入，即

from scipy import stats

以及在 linregress 操作之前直接导入，即

from scipy.stats import linregress
s, i, r, p, se = linregress(x, y)

最后，我尝试查看导入到“bar”的任何其他模块是否干扰scipy.stats，但事实并非如此。

知道为什么 python 会“忘记”scipy.stats吗？

我还尝试通过在调用 foo 之前编写在“bar”中导入的所有模块的列表来检查 scipy.stats 是否已导入；

with open('modules_on_import.txt', 'a') as f:
    for s in sys.modules:
        f.write(f"{s}\n")
f.close()

和 scipy.stats 可以在 modules_on_import.txt 中找到

更多细节：

1. 我没有在虚拟环境中运行，echo $VIRTUAL_ENV 没有返回任何内容。
2. 一切都通过命令行运行，即直接在 Bash 中运行。在这种情况下，我只需输入python3 bar.py。
3. 通过命令行使用 pip 安装的所有模块 - 即 pip install scipy
4. 不确定是否重要，但我正在 vim 进行编辑。

bar.py 的（简化）示例。

from psd_processing import process_psd # function to make df_2 and data_dict
from uptake_processing import process_uptake # function to make df_1
from foo_test import foo

project = '0020'
loading_df = process_uptake(project, 'co2', 298) # this works
param_df, data_dict = process_psd(project, 'n2', 'V') # this works
correlation_df = foo(loading_df, param_df, data_dict) # this breaks on linregress in foo.py

不是scipy的安装方式。我用pip3 卸载并重新安装了。

但是，当我通过 Spyder IDE 运行代码时，它可以工作！ 一些相关信息；

1. 我最初是通过 Windows 10 x86_64 上的 Ubuntu 20.04.3 LTS 运行代码。我的 Python 安装在 Ubuntu 上的 /usr 中。
2. 在 Spyder 中运行时，代码直接在 Windows 上运行。 python安装在C:\Users\<user>\Anaconda3。

如何让这段代码通过命令行正常运行？

Answer 1

如问题中所述，此代码适用于 Windows 中的 conda venv，但不适用于直接安装在 Ubuntu WSL 上的 python3。由于我的偏好是使用 linux 命令行，因此我做了以下解决方法；

1. Install Anaconda on the Ubuntu WSL。
2. 创建并激活虚拟环境。
3. 通过conda install <pkg>在虚拟环境中安装所需的包。
4. 在新的虚拟环境中运行一切。