双向重复测量ANOVA python函数答案

【问题标题】：Two-way repeated measures ANOVA python function双向重复测量ANOVA python函数
【发布时间】：2014-04-27 09:47:51
【问题描述】：

提前感谢您的任何回答。我想在 python 中进行 2 路重复测量方差分析，其中一个 IV 有 5 个级别，另外 4 个级别，有一个 DV。我尝试在 scipy 文档和一些在线博客中四处寻找，但似乎找不到任何东西。

【问题讨论】：

据我所知，混合效果和层次模型还没有在 scipy 中完全实现。有一个混合效果沙盒模块没有完成，但我不知道结果有多准确。如果你愿意，你可以看看 PyStan。它需要更多的编码，但您可以分析您想到的任何模型。
谢谢 - 我去看看。

标签： python statistics

【解决方案1】：

您可以使用 Pingouin 包（我是它的创建者）中的 rm_anova 函数，该函数直接与 pandas DataFrame 一起使用，例如：

import pingouin as pg

# Compute the 2-way repeated measures ANOVA. This will return a dataframe.
pg.rm_anova(dv='dv', within=['iv1', 'iv2'], subject='id', data=df)

# Optional post-hoc tests
pg.pairwise_ttests(dv='dv', within=['iv1', 'iv2'], subject='id', data=df)

【讨论】：

【解决方案2】：

这是一个老问题，但我会提供答案。

您可以查看pyvttbl。使用这个库（可以通过 Pip 安装），您可以对独立和重复测量（以及混合设计）执行 n 路 ANOVA。请注意，您似乎必须使用 Pyvttbl 自己的数据框方法来处理您的数据。

很简单：

dataframe.anova('dv', sub='id', wfactors=['iv1',      'iv2'])

您可以查看我的博客文章，了解有关如何执行2-way ANOVA for repeated measures 的更详细示例。

【讨论】：