如何在 Windows 操作系统中从 R 调用 Python？

Question

我正在寻找一种在 Windows 操作系统上的 R 中调用 python 的方法。由于似乎没有现成的 R 包（至少没有最近更新的包），我正在寻找有关如何在 R 脚本中编写一组命令的线索，然后可以以批处理模式发送到Python。

简而言之，如何在 Windows 操作系统中从 R 调用 python？

编辑：澄清一下，我不是询问是否从 python 调用 R；相反，我问的是从 R 调用 python。

更新：根据我目前收集到的信息，以下是在 Windows 操作系统中从 R 运行 python 的一组基本命令：

# (1) basic python commands called from R
system('python -c "a = 2 + 2; print a"') 
system('python -c "a = \'hello world\' ; print a; import pandas"')

# (2) if you have a python file you've already created (which I've referred to as "my.py"), then you can run it in R as follows:
system("python C:\\Users\\Name\\Desktop\\my.py")

# or alternatively:
system('python -c "import sys; sys.path.append(\'C:\\Users\\Name\\Desktop\'); import my;"')

这些方法都没有达到在 Windows 操作系统上使用 R 语言中的 python 进行流体数据分析所需的交互性水平。最直接的解决方案可能是编写一个简单的 R 函数，该函数 (1) 将指定的 R 数据帧导出到 python，(2) 解析用 R 编写的 python 语法（使用 stringr 和 system('python -c')），然后 (3)可选择将数据导出回 R。这将是 R 中基于通过 R 控制台更新临时 python 文件的伪交互。

Answer 1

你可以使用这个包PythonInR

Answer 2

制作一个python文件....

# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Wed Mar  9 09:55:46 2016

@author: Subhash Jaini
"""

import pandas as pd
d = {'First' : [1., 2., 3.],'Second' : [1,2,3]}


AA = pd.DataFrame(d)
print(AA)

---

保存到一个地方（我使用了 c:/deleteme/pythonRun.py）

在 R 中，运行此代码。

#calls the python script to run in shell
BlobReturnedFromPython = shell('python c:/deleteme/pythonRun.py',intern=TRUE)
#get the first line and turn it to your header
HEADER = gsub(" ","",unlist(strsplit(as.character(BlobReturnedFromPython[1]),"  ")))[-1]
#all the rest of the data is non header data
NONHEADER = BlobReturnedFromPython[2:(length(BlobReturnedFromPython)-1)]
#turnthat blob (which is seperated by about 4 spaces )
DATA = data.frame(sapply(NONHEADER,function(x){unlist(strsplit(x,"    "))}))
#brings those names into the data set
names(DATA) <- HEADER
DATA    

Answer 3

我找到了一个可以在 Windows 操作系统上实际运行的解决方案：

http://gallery.rcpp.org/articles/rcpp-python/

本文描述了 Ubuntu 的设置，其中 Rcpp 用作 R 和 Python 之间的中间层。虽然我还没有尝试过，但我目前看不出为什么这个解决方案也不能在 Windows 上运行。

Answer 4

如果您正在寻找从 R 调用 python，请尝试rPython，但它不适用于 Windows 操作系统。 或者试试RSPython对windows的支持较弱。另一个有用的link。

最后您可以尝试使用Cygwin 之类的东西在您的Windows 操作系统上执行Linux 应用程序。更多的工作量将是在 Windows 上使用一些虚拟环境，如 VMware 或 VirtualBox 并安装 linux 并执行您的工作。