【发布时间】:2011-03-18 13:43:57
【问题描述】:
在 Matlab 中,如果我仍然需要对稀疏数组进行大量计算,并且大约 25% 的数组是非零的,那么稀疏数组在什么时候比普通数组更好?
【问题讨论】:
标签: matlab performance sparse-matrix
在 Matlab 中,如果我仍然需要对稀疏数组进行大量计算,并且大约 25% 的数组是非零的,那么稀疏数组在什么时候比普通数组更好?
【问题讨论】:
标签: matlab performance sparse-matrix
就个人而言,对于只有 25% 非零的数组,我很少会为稀疏而烦恼。不信你自己试试看。
A = sprand(2000,2000,0.25);
tic,B = A*A;toc
Elapsed time is 1.771668 seconds.
Af = full(A);
tic,B = Af*Af;toc
Elapsed time is 0.499045 seconds.
作为稀疏矩阵所涉及的额外工作成本太高,不值得费心。现在尝试使用一个非常稀疏的矩阵。
A = sprand(2000,2000,0.005);
Af = full(A);
tic,B = A*A;toc
Elapsed time is 0.037763 seconds.
tic,B = Af*Af;toc
Elapsed time is 0.446680 seconds.
当然,您自己的问题会有所不同,但不会有那么大的不同。稀疏矩阵对于使用真正稀疏矩阵的人来说是一个真正的福音,但在大多数情况下,25% 的非零值根本不够“稀疏”。
【讨论】:
编辑 - 误读了问题。
在 75% 的稀疏度下,您很可能会看到稀疏矩阵算法的性能显着提高。我会说这绝对值得一试。
您将节省的两个地方 - 内存(将内存使用减少四倍)和操作(例如,每次执行矩阵向量乘法时,您将大大减少所需的操作数量)。在您的情况下,缓解因素很可能是矩阵的大小。转向稀疏矩阵运算,您通常会失去在密集矩阵中看到的良好缓存特性。因此,通常存在一个阈值,即从密集到稀疏的移动会导致效率提高。
【讨论】: