R获取AUC并同时绘制多条ROC曲线

Question

我尝试了 2 种方法来绘制 ROC 曲线并获得每条 ROC 曲线的 AUC。

方法一 - 第一种方法很简单但我不知道如何将多条ROC曲线绘制在一起。 我只是使用roc.curve(hacide.test$cls, pred_rose[,2])，输出将显示 ROC 曲线并给我 AUC。

方法二 我现在可以同时绘制多条 ROC 曲线，但不能同时获得 AUC。 这是我将多条 ROC 曲线绘制在一起的方式：

library(ROCR)
pd1 <- prediction(pred_rose[,2], hacide.test$cls)
pf1 <- performance(pd1, "tpr","fpr")

pd2 <- prediction(pred_both[,2], hacide.test$cls)
pf2 <- performance(pd2, "tpr","fpr")

plot(pf1, colorize = TRUE)
plot(pf2, add = TRUE, colorize = TRUE)

这是我获得 AUC 的方式：

pf <- performance(pd3, "auc")
pf     # y.values is the AUC

如您所见，当我使用第二种方法时，用于获取 ROC 曲线和 AUC 的 performance() 方法是不同的。这里pf1、pf2的输出没有AUC值。

方法 1 比较简单，但是你知道我如何使用方法 1 将 ROC 曲线绘制在一起并仍然保留每个 AUC 值吗？

Answer 1

您可以使用pROC 包来做到这一点。在对plot 的调用中使用print.auc 参数：

library(pROC)
roc_rose <- plot(roc(hacide.test$cls, pred_rose[,2]), print.auc = TRUE, col = "blue")

对于第二条 ROC 曲线，您需要更改 AUC 的 y 位置并使用 add 将两条曲线绘制在同一个图上：

roc_rose <- plot(roc(hacide.test$cls, pred_both[,2]), print.auc = TRUE, 
                 col = "green", print.auc.y = .4, add = TRUE)