【问题标题】:Installing AutoSKLearn in Anaconda Environment在 Anaconda 环境中安装 AutoSKLearn
【发布时间】:2019-07-15 23:17:23
【问题描述】:

我正在尝试在 anaconda 环境 AutoSKLearn 中安装 autosklearn,之后我正在使用 jupyter notebook 并尝试 import autosklearn.classification 但我收到此错误,“ValueError:numpy.ufunc 大小已更改,可能表示二进制不兼容。预期216 来自 C 标头,192 来自 PyObject”。我该如何解决这个错误?

【问题讨论】:

    标签: python anaconda


    【解决方案1】:

    尝试: conda install -c conda-forge auto-sklearn

    https://anaconda.org/conda-forge/auto-sklearn

    【讨论】:

      【解决方案2】:

      **** 如何在 Mac OS Big Sur 11.2.1 和 gcc 10.2.04 上安装 auto-sklearn 和 pyrtr ****

      这就是我在 Anaconda 3 下的 Mac OS Big Sur 上成功安装 auto-sklearn 的方法

      瓶颈是使用最新的 gcc 编译器来安装 pyrfr,它是 auto-sklearn 的依赖项,以及其他一些东西。 在 Mac OS 上,C++ 和 dev 工具是通过 xcode-select 安装的,而 C++ 编译器的默认版本不是我们需要的(参考这个thread):

      gcc --version

      默认是 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/clang

      首先,确保所有内容都已更新:

      xcode-select --install

      酿造更新 冲泡升级 酿造信息 gcc 酿造安装 gcc 冲泡清理 酿造医生

      并且也更新 conda,以防万一:

      conda 更新 -n 基础 conda 康达更新--全部

      (“conda install gcc”对我不起作用,就像一些线程建议的那样,“conda config --set restore_free_channel true”也没有帮助) 如果“冻结”

      conda update -prefix /opt/anaconda3 anaconda

      但是“brew install gcc”为我安装了 gcc,现在我们只需要在 ~/.zshrc(或 ~/.bash_profile 或 ~/.bashrc,如果你还没有切换到使用 zsh,它是较新的 Mas OS 中的默认值)

      酿造 gcc 信息 gcc:稳定 10.2.0(瓶装),HEAD GNU 编译器集合 https://gcc.gnu.org/ /usr/local/Cellar/gcc/10.2.0_4

      建议,我的 gcc 现在在 /usr/local/Cellar/gcc/10.2.0_4/bin/gcc-10 查看: /usr/local/Cellar/gcc/10.2.0_4/bin/gcc-10 -v

      制作别名:

      vi ~/.zshrc 添加别名 别名 gcc="/usr/local/Cellar/gcc/10.2.0_4/bin/gcc-10" 源码~/.zshrc

      现在,继续安装:

      brew install swig 点安装延迟导入 pip install pyrfr --no-cache-dir pip install auto-sklearn --no-cache-dir

      完成!

      也许,这会有所帮助:

      pip 卸载 pyrfr auto-sklearn 卷曲https://raw.githubusercontent.com/automl/auto-sklearn/master/requirements.txt | xargs -n 1 -L 1 点安装 CC=/usr/local/Cellar/gcc/10.2.0_4/bin/gcc-10 pip installlazy-import pyrfr auto-sklearn --no-cache-dir

      或者,如果你设法在 Anaconda3 中安装了 gcc:

      pip 卸载 pyrfr auto-sklearn 卷曲https://raw.githubusercontent.com/automl/auto-sklearn/master/requirements.txt | xargs -n 1 -L 1 点安装 CC=/Users//opt/anaconda3/bin/gccpip install pyrfr auto-sklearn --no-cache-dir

      也许,你需要重新安装auto-sklearn,然后

      pip install autosklearn --no-cache-dir --force-reinstall -I --no-deps --upgrade

      可能有助于实现目标的其他资源: https://medium.com/@dvdasari/install-latest-gcc-on-mac-os-x-b4ce9a66a184 http://www-scf.usc.edu/~csci104/installation/gccmac.html https://github.com/automl/auto-sklearn/issues/155

      【讨论】:

        【解决方案3】:

        根据 autosklearn 文档,它不会在 windows 上正式支持,

        auto-sklearn relies heavily on the Python module resource. resource is part of Python’s Unix Specific Services and not available on a Windows machine. Therefore, it is not possible to run auto-sklearn on a Windows machine.
        
        Possible solutions (not tested):
        
        Windows 10 bash shell
        
        virtual machine
        
        docker image
        

        【讨论】:

          【解决方案4】:

          一切都在解释here

          Anaconda 安装
          Anaconda 不提供 auto-sklearn,也没有 conda 包 用于自动 sklearn。因此,最容易安装 auto-sklearn 为 在安装 auto-sklearn 一节中有详细说明。

          最近的 Linux 发行版下的一个常见安装问题是 用于编译 Python 的编译器版本不兼容 AnaConda 提供的二进制文件和安装的编译器 分配。这可以通过安装 gcc 编译器来解决 随 AnaConda(以及 swig)一起提供:

          conda install gxx_linux-64 gcc_linux-64 swig

          【讨论】:

          • 我已经安装了 linux 包。现在下一步是什么?运行 conda install autosklearn 没有帮助。请问可以吗?
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