如何在 python 中创建堆积线图？答案

【问题标题】：How can I create a plot of stacked lines in python?如何在 python 中创建堆积线图？
【发布时间】：2020-03-21 02:02:58
【问题描述】：

我有 300 个单个细胞在 200 个时间步长的荧光值。我想将它们全部绘制在一个堆叠在另一个之上的同一个图形上。我不想绘制堆积面积图。下面的图像是我正在寻找的，但本质上它是每个单元格的数据绘制在其自己的单独 y 轴上，所有单元格都具有相同的 x 轴。

【问题讨论】：

您的数据是什么样的？时间步长作为索引，单元格作为列？
没错。我目前有一个熊猫数据框，其中时间步长作为索引，每个单元格作为一列。
我要么创建共享 x 轴的子图，要么为每个数据集的 y 值添加一个偏移值以强制分离。

标签： python pandas matplotlib data-visualization seaborn

【解决方案1】：

python 中的主要绘图工具（与 pandas 一起使用）是 matplotlib（较旧）和 seaborn（较新且更小）。

查看 seaborn 的文档 (https://seaborn.pydata.org/tutorial/axis_grids.html) 和食谱页面 (https://python-graph-gallery.com/122-multiple-lines-chart/) 对于多组分复合图，您可以像这样显示您的荧光数据：

# libraries
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import pandas as pd

# Data
df=pd.DataFrame({'x': range(100), 
                 'trace1': np.random.randn(100), 
                 'trace2': np.random.randn(100)+10, 
                 'trace3': np.random.randn(100)+20})

# multiple line plot
plt.plot( 'x', 'trace1', data=df, marker='', color='black', linewidth=2)
plt.plot( 'x', 'trace2', data=df, marker='', color='black', linewidth=2)
plt.plot( 'x', 'trace3', data=df, marker='', color='black', linewidth=2, label="GluK1c")
plt.legend()

我不喜欢那种 hack（向每个轨迹的 y 值添加数字），因为应该有一种方法可以偏移您的 y 轴值在matplotlib 内，但我在谷歌搜索时找不到该选项。

在这种情况下，因为您想要极简的黑线迹线（神经科学期刊所期望的），所以 matplotlib 和 seaborn 具有可比性。

有关大量图例位置/格式选项，请参阅https://matplotlib.org/3.1.1/api/_as_gen/matplotlib.pyplot.legend.html

我希望我在实验室工作时拥有这些工具。会比我当时做的更好。

【讨论】：

【解决方案2】：

你可以这样做，例如：

your_df.plot(subplots=True, layout=(10,30));

【讨论】：