【发布时间】:2015-11-25 16:36:18
【问题描述】:
我在 python 中通过pandas 使用pytables。我正在尝试使用 pandas.read_hdf() 加载文件,但我收到了这个令人讨厌的错误。我希望我没有丢失我的 1.1 gigs 不可替代的数据。在保存过程中我没有看到任何错误。一切似乎都运行良好。
有人能解释一下这个错误在说什么吗?
还有,有什么办法可以恢复吗?
HDF5ExtError: HDF5 error back trace
File "H5Dio.c", line 174, in H5Dread
can't read data
File "H5Dio.c", line 449, in H5D_read
can't read data
File "H5Dchunk.c", line 1729, in H5D_chunk_read
unable to read raw data chunk
File "H5Dchunk.c", line 2755, in H5D_chunk_lock
unable to read raw data chunk
File "H5Fio.c", line 113, in H5F_block_read
read through metadata accumulator failed
File "H5Faccum.c", line 254, in H5F_accum_read
driver read request failed
File "H5FDint.c", line 142, in H5FD_read
driver read request failed
File "H5FDsec2.c", line 720, in H5FD_sec2_read
addr overflow, addr = 1108161578, size=7512, eoa=1108155712
【问题讨论】:
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您的文件已损坏。我只在有人尝试使用严格禁止的多个进程/线程编写时才看到这一点。
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我发布了一个类似的问题,您回答了,多进程问题并非不可能。我认为在这种情况下可能会有所不同,因为我没有看到与以前相同的错误,并且错误本身是不同的。
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我已经看到即使磁盘出现问题也会发生这种情况。 HDF5 相当不错,但需要备份 :)
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好的,谢谢。如果您想回答这个问题,请提供指向另一个问题的链接(以帮助任何收到这些不同错误消息的人)我会接受。
标签: python pandas hdf5 pytables