使用 pytables 获取 hdf5 组的名称答案

【问题标题】：Get name of an hdf5 group using pytables使用 pytables 获取 hdf5 组的名称
【发布时间】：2021-03-27 08:42:41
【问题描述】：

import tables
f = tables.open_file('my_file.hdf5', mode='w')
f.create_group(f.root, name='videos')

我有另一个将数据添加到“视频”组的脚本。此脚本检查“视频”组是否已存在；如果 'videos' 尚不存在，脚本将创建一个 'videos' 组。

如何检查组是否已存在？我尝试使用 f.walk_groups() 和 f.root._v_groups，但这些似乎不是最好的解决方案。以及如何获取包含 f.root 中所有组的名称（作为字符串）的列表？

【问题讨论】：

标签： hdf5 pytables

【解决方案1】：

您需要做的就是检查根组中是否存在组/数据集路径名。这将返回 True/False：'/videos' in f.root
所以你可以像这样创建一个if 块：

if '/videos' in f.root:
    do something

这是一个简短的代码段，它创建一个组 + 2 个数组数据集，然后打印组和 2 个数据集的逻辑测试。请注意，arr3 不存在。

import tables as tb
import numpy as np

with tb.File('SO_65327481.hdf5', mode='w') as h5f:
    h5f.create_group('/', name='videos')
    arr = np.random.random((10,10))
    h5f.create_array('/videos',name='arr1', obj=arr)
    arr = np.random.random((10,10))
    h5f.create_array('/videos','arr2',obj=arr)

    print ( 'videos exists:', '/videos' in h5f.root)
    print ( 'arr2 exists:', '/videos/arr2' in h5f.root)
    print ( 'arr3 exists:', '/videos/arr3' in h5f.root)

输出将是：

videos exists: True
arr2 exists: True
arr3 exists: False

【讨论】：