不使用 xdmf 在 Paraview 上从 X_Y_Z（单独的数据集）可视化 3 维网格

Question

使用 xdmf 使用 Paraview 读取 netcdf 文件

我曾经使用xdmf 脚本解析netcdf 文件，以便在paraview 上创建3DSMesh。最重要的是，我添加了标量或向量场。 （所以 3DSMesh 提供了物理坐标）。

我从来没有想过实际上是否是最好的方法。它有效，所以我很好。 如果有更方便的方法请告诉我。

我可以使用以下脚本创建一个 3 维网格。

<?xml version="1.0" ?>
<!DOCTYPE Xdmf SYSTEM "Xdmf.dtd" []>
<Xdmf xmlns:xi="http://www.w3.org/2001/XInclude" Version="2.0">
   <Domain>
      <Grid Name="gridxyz">
        <Topology TopologyType="3DSMesh" NumberOfElements="0032 0032 0063">
        </Topology>
<!-- Read Coordinates -->
        <Geometry GeometryType="X_Y_Z">
           <DataItem Name="X" Format="HDF" NumberType="Float" Precision="8" Dimensions="0032 0032 0063">
                       grid_x.nc:/gridx
           </DataItem>
           <DataItem Name="Y" Format="HDF" NumberType="Float" Precision="8" Dimensions="0032 0032 0063">
                       grid_y.nc:/gridy
           </DataItem>
           <DataItem Name="Z" Format="HDF" NumberType="Float" Precision="8" Dimensions="0032 0032 0063">
                       grid_z.nc:/gridz
           </DataItem>
        </Geometry>
<!-- Read Scalar -->
<!-- Here I have bunch of scalars stored in different netcdf files -->
     </Grid>
   </Domain>
</Xdmf>

优点

• xdmf 脚本非常适合需要重复性任务。

缺点

• 此脚本需要以某种方式生成，或手动输入。并且需要更新，当尺寸或变量名称发生变化时

• 如果我想读取另一个标量，我需要添加一行

• 网格可以在两个方向上统一，第三个方向不统一，无需创建 3D 网格文件，但几何类型 dx_dy_dz 不足以实现。

我在寻找什么

最近我意识到，只需单击打开（Paraview4.3），我就可以使用 paraview 打开 netcdf 文件。所以，我不再需要这些 xdmf 脚本了（几年前我无法在 Paraview 上打开 netcdf 文件）。

如何通过 Paraview GUI 创建3DSMesh。那可能吗？还是有任何其他简单/更快的方法（而不是编写 python 脚本）？ 有什么方法可以读取 1D 坐标并使用它们创建 3D 几何？

Answer 1

这就是我设法做到这一点的方式。当然这不是最快的方法，但它对我有用。

当您打开 NetCDF 文件时，paraview 要求您选择阅读器，我总是使用 NetCDF 文件通用和 CF 约定。

之后，在点击“应用”按钮之前，您必须在下拉菜单中选择适当的“维度”。

您的数据现在必须显示为 UniformGrid，您的数据 (X,Y,Z) 为标量字段，因此您必须转换为 grid 以更具体地成为 StructuredGrid。为此，请应用 "ImageDataToPointSet" 过滤器。

之后，应用 “计算器” 过滤器检查“坐标结果” 字段并执行以下操作：

如果您的数据显示为 X、Y、Z 列，则将表达式放在计算器字段中

(X * iHat) + (Y * jHat) + (Z * kHat)

如果您的数据以其他名称出现，请将 x、y、z 替换为这些名称

表达式表示x在î向量的方向，y在j向量的方向等等

希望对您有所帮助！