按照创建的顺序读取/写入 HDF5 文件

Question

我正在使用 HDF5 文件对 C++ 类数据进行某种“序列化”。有没有办法让 HDF5 文件按照创建顺序访问每个数据集？

我选择 HDF5 是因为我需要从我的程序外部访问数据以及能够恢复我的程序状态。

谢谢！

Answer 1

对我来说，能够按照创建顺序遍历组（可能还有其子组）中的数据集就足够了。为此，（如上面所说的 embert）必须使用 H5P_CRT_ORDER_TRACKED | 创建文件中的组。 H5P_CRT_ORDER_INDEXED 标志设置。也就是说，调用：

hid_t group_creation_plist;
group_creation_plist = H5Pcreate(H5P_GROUP_CREATE);
status = H5Pset_link_creation_order(group_creation_plist, 
                                 H5P_CRT_ORDER_TRACKED | H5P_CRT_ORDER_INDEXED);

然后使用以下方法创建组：

hid_t group_id;
group_id = H5Gcreate(id_file, 
                     "/mydata", 
                     H5P_DEFAULT, 
                     group_creation_plist, 
                     H5P_DEFAULT);

将所有数据添加到新组。要按排序的创建顺序遍历组，您必须使用H5Literate 函数，确保将index_type 参数设置为H5_INDEX_CRT_ORDER。

    status = H5Literate (group_id, 
                         H5_INDEX_CRT_ORDER, // Note this argument
                         H5_ITER_INC, 
                         NULL, 
                         op_func,
                     (void *) &od);

从组开始迭代很重要，而不是从根开始。我无法使根组保持创建链接的顺序。解决这个问题的方法就是在根目录下创建一个带有适当标志的组。

使用H5Literate 有点棘手，特别是如果想要对子组进行递归遍历。在here 和documentation 中找到了一个很好的例子。