合并 Netcdf 文件答案

【问题标题】：merging of Netcdf files合并 Netcdf 文件
【发布时间】：2013-06-28 19:36:42
【问题描述】：

我有大约 500 个 netcdf(.nc) 文件。我需要将所有这些文件合并到一个文件中。我是编程新手，我没有足够的知识来合并这些文件。谁能解释一下我们如何可以合并这些文件并提取到 csv 文件或 excel 表。我们可以使用哪个函数来合并文件。任何帮助将不胜感激。

【问题讨论】：

您可以组合 netCDF 文件中的变量（如果它们具有相同的维度）。如果变量具有无限维度，则最好这样做，您可以使用它来附加所有文件。但是您也可以添加一个新维度并在那里加入文件。无论如何，结果将取决于您的数据结构，因此不可能有通用的答案。

标签： csv metadata netcdf

【解决方案1】：

试试这个 shell 脚本来合并你拥有的 500 个 netcdf 文件。这是您可以做什么的粗略想法：

  i=1
  for X in `ls -1 *nc`
  do
       cdo merge $X temp.nc out.nc
       i=`expr $i+1`
       if [i!=500];  #This is the run so you want to keep out as your final output
       then 
           mv out.nc temp.nc ##### for use in future merges.  This will build up as $X nc files get merged to it.
  done

【讨论】：

【解决方案2】：

NCO 的 ncecat 可以将任意数量的 netCDF 文件组合在一起

ncecat in1.nc in2.nc ... inN.nc out.nc
ncecat in*.nc out.nc

documentation 中描述了开关和其他选项。

【讨论】：

【解决方案3】：

您可以使用

合并具有不同变量的文件

cdo merge in1.nc in2.nc ... inN.nc out.nc

或者如果它们是不同时间段的相同变量，则可以沿时间轴合并

cdo mergetime in1.nc in2.nc ... inN.nc out.nc

但请注意，要执行此 CDO 必须同时打开所有输入文件，并且在某些系统上，打开文件的数量限制为 256。因此，要合并 500 个文件，您需要分 2 个或更多步骤完成。

【讨论】：