带有 libnetcdf-fortran 的 OSError：未定义的符号答案

【问题标题】：OSError with libnetcdf-fortran: undefined symbol带有 libnetcdf-fortran 的 OSError：未定义的符号
【发布时间】：2017-03-23 11:57:23
【问题描述】：

我必须在我的 Linux (Ubuntu 15.10) 上更新一些 Anaconda/Python 软件包，结果我现在收到以下我以前从未见过的错误消息：

OSError: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnetcdff.so.6: undefined symbol:nc_rename_grp

在 Python 脚本中调用基于 Fortran 的程序时会发生该错误。但是，在没有 Python 的情况下运行相同的程序时，一切正常...

更新后我也重新编译了程序，但没有任何改变。

有人知道这里发生了什么吗？

【问题讨论】：

我认为 anaconda 在其目录结构的某处提供了自己的 netcdf 库版本。也许您正在使用一个动态链接的对象，当从 anaconda 中运行时，该对象期望使用 anaconda lib 版本（可能有额外的符号），但您的 LD_LIBRARY_PATH 或类似意味着它正在获取系统版本（反之亦然） .您能否稍微详细说明一下“基于 fortran”的程序是什么以及如何运行它，即您是否只是在 python 中使用系统调用来运行可执行文件？如果是这样，您可以从 python 和外部 python 执行ldd myExecutable。
在英式英语中，program 是指计算机程序及其编程，program 用于该词的所有其他含义。

【解决方案1】：

感谢大家的帮助。该问题是由 ./bashrc 中的 netcdf 库路径设置错误引起的，因此程序（即计算机程序/模型）无法正常工作。现在一切都已解决，程序/模型已启动并运行！

【讨论】：

【解决方案2】：

符号 nc_rename_grp 在 libnetcdf.so 中定义。如果您使用子进程运行 FORTRAN 代码，那么您必须按如下方式声明 env：

env["LD_LIBRARY_PATH"] = "/usr/lib/x86_64-linux-gnu"
h = subprocess.Popen(cmd,env=env)

【讨论】：