从 hdf5 文件中提取数据到 numpy 数组中答案

【问题标题】：Extract data into numpy arrays from hdf5 file从 hdf5 文件中提取数据到 numpy 数组中
【发布时间】：2021-03-23 20:36:09
【问题描述】：

尽管围绕此任务找到了一些资源，但我无法从 hdf5 文件中提取数据（对于我正在学习的 Datacamp 课程）。

我想在我的本地系统上处理这些示例。

这就是我所拥有的：

import h5py
import numpy as np
import pandas as pd

filename = "e:\\python\\datacamp\\time_series_with_python\\machine_learning_for_time_series_data_in_python\\audio_munged.hdf5"
'''
data = pd.read_hdf(filename, key)
data = pd.read_hdf(filename, 'h5io')
print(data)
# Reading the file
'''

f = h5py.File(filename, 'r')

# Studying the structure of the file by printing what HDF5 groups are present

for key in f.keys():
    print(key)  # Names of the groups in HDF5 file.

    # Extracting the data

    # Get the HDF5 group
    group = f[key]

    # Checkout what keys are inside that group.
    for gkey in group.keys():
        print(gkey)
    # key_data = group['key_data'].value   <-- This generates an error

我明白了：

h5io
key_data
key_meta
key_sfreq

Traceback (most recent call last):
  File "C:/Users/Mark/PycharmProjects/main/main.py", line 27, in <module>
    key_data = group['key_data'].value
AttributeError: 'Group' object has no attribute 'value'

问题 #1：如何将 'key_data'、key_meta' 和 'key_sfreq' 中的值提取到单独的 numpy 数组中？

问题 #2：我尝试简单地将 hdf5 文件拉入 pandas（上面的代码），但我不知道什么是正确的 'key' 参数的值应该是。我试过 h5io 但这不正确。然后我尝试了其他三个（key_），所有这些都失败了。

【问题讨论】：

试试group['key_data'] 或group['key_data'].values()
选项 1 产生：选项 2 产生：ValuesViewHDF5()

标签： python-3.x pandas numpy h5py

【解决方案1】：

我在这里找到了我要找的东西：

https://stackoverflow.com/questions/34330283/how-to-differentiate-between-hdf5-datasets-and-groups-with-h5py

我没有深入。用户“Yas”发布的代码向我展示了如何获取这些值。

【讨论】：