如何将H5文件打印到文本文件？

Question

我可以按如下方式在 Python 中加载 H5 文件。

import h5py

filename = 'brainwash_800000.h5'
f = h5py.File(filename, 'r')

我想将f 中的所有内容打印到一个文本文件中。 我该怎么做？

编辑： 我可以将 Keys 打印为

import numpy as np
import h5py
filename = 'brainwash_800000.h5'
f = h5py.File(filename, 'r')
print(f.keys())

输出是

[u'conv1', u'conv2', u'forget_gate', u'inception_3a', u'inception_3b', u'inception_4a', u'inception_4b', u'inception_4c', u'inception_4d', u'inception_4e', u'inception_5a', u'inception_5b', u'input_gate', u'input_value', u'ip_bbox_unscaled0.p0', u'ip_bbox_unscaled0.p1', u'ip_bbox_unscaled1.p0', u'ip_bbox_unscaled1.p1', u'ip_bbox_unscaled2.p0', u'ip_bbox_unscaled2.p1', u'ip_bbox_unscaled3.p0', u'ip_bbox_unscaled3.p1', u'ip_bbox_unscaled4.p0', u'ip_bbox_unscaled4.p1', u'ip_conf0.p0', u'ip_conf0.p1', u'ip_conf1.p0', u'ip_conf1.p1', u'ip_conf2.p0', u'ip_conf2.p1', u'ip_conf3.p0', u'ip_conf3.p1', u'ip_conf4.p0', u'ip_conf4.p1', u'output_gate', u'post_fc7_conv.p0', u'post_fc7_conv.p1']

如何在文本文件中打印这些键和值？

Answer 1

如何转储 HDF5 文件取决于文件中的内容。

例如，对于单个数据集，输出格式可以稍后输入到 NumPy，例如

import numpy as np
import h5py
filename = 'brainwash_800000.h5'
f = h5py.File(filename, 'r')
np.savetxt('datafile.txt', f['dataset'][...])
f.close()

您也可以为此目的使用 h5dump，但它会产生逗号分隔的值。

h5dump -d dataset -o brainwash_800000.txt -y brainwash_800000.h5

而且您还会丢失数据的维度。您可以保留这些信息，但代价是每行都以 N 维中的数据偏移量开始。