无法为 Python 2.7 重新安装 PyTables答案

【问题标题】：Unable to reinstall PyTables for Python 2.7无法为 Python 2.7 重新安装 PyTables
【发布时间】：2011-06-25 17:13:31
【问题描述】：

除了 2.7 之外，我还要安装 Python 2.7。再次为 2.7 安装 PyTables 时，出现此错误 -

发现安装了 numpy 1.5.1 包。 .. 错误:: 找不到本地 HDF5 安装。您可能需要明确说明您的本地 HDF5 标头和可以通过设置HDF5_DIR 环境找到库变量或使用--hdf5 命令行选项。

我不清楚 HDF 的安装。我再次下载 - 并将其复制到 /usr/local/hdf5 目录中。并尝试按照 PyTable 安装中的建议设置环境变量。有没有其他人遇到过这个问题可以提供帮助？

【问题讨论】：

【解决方案1】：

执行以下步骤：

【讨论】：

【解决方案2】：

我必须先安装libhdf5-8 和libhdf5-serial-dev。

然后，对我来说，Ubuntu 上的命令是：

export HDF5_DIR=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/

【讨论】：

【解决方案3】：

这对我不起作用。

在 Ubuntu 13.10 上——在下载了最新的 hdf5 和它的 python 句柄后，当我使用的依赖库找不到它们时，我 sudo'd 为 hdf5 的头文件创建一个符号链接——我正在使用 pac bio 核心库进行自定义虽然使用

sudo updatedb

和

locate hdf5

在我下载并安装了核心库和 python 句柄后，确实在我的路径中找到了它们

wget http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/current/src/hdf5-1.8.12.tar.gz

和

wget https://pypi.python.org/packages/source/h/h5py/h5py-2.2.1.tar.gz

我必须做到以下几点：

export HDF5_DIR=/mnt/hdf5-1.8.12/hdf5/

pip install tables --force

【讨论】：

【解决方案4】：

我的HDF5 是用自制软件安装的，所以如下设置环境变量对我有用：HDF5_DIR=/usr/local/Cellar/hdf5/1.8.9

【讨论】：

【解决方案5】：

未正确说明 hdf5 命令行选项 (--hdf5='/usr/local/hdf5')。在 setup.py 中添加打印语句可以更容易地确定问题。

【讨论】：