【发布时间】:2020-03-13 12:57:05
【问题描述】:
我有很多这样命名的文件:
BH_Undetermined_S0_L001_R1_001.fastq.gz__1.fq.gz
BH_Undetermined_S0_L001_R1_001.fastq.gz__merged.fq.gz
BH_Undetermined_S0_L001_R2_001.fastq.gz__2.fq.gz
BHos1_S1_L001_R1_001.fastq.gz__1.fq.gz
BHos1_S1_L001_R1_001.fastq.gz__merged.fq.gz
BHos1_S1_L001_R2_001.fastq.gz__2.fq.gz
BHos2_S2_L001_R1_001.fastq.gz__1.fq.gz
BHos2_S2_L001_R1_001.fastq.gz__merged.fq.gz
BHos2_S2_L001_R2_001.fastq.gz__2.fq.gz
ChLJ1511Da_HNVMLBCXX_L2_1.fq.gz__1.fq.gz
ChLJ1511Da_HNVMLBCXX_L2_1.fq.gz__merged.fq.gz
ChLJ1511Da_HNVMLBCXX_L2_2.fq.gz__2.fq.gz
ChLJ1511Db_HNVMLBCXX_L2_1.fq.gz__1.fq.gz
ChLJ1511Db_HNVMLBCXX_L2_1.fq.gz__merged.fq.gz
ChLJ1511Db_HNVMLBCXX_L2_2.fq.gz__2.fq.gz
ML-3_H7VFTALXX_L2_1.fq.gz__1.fq.gz
ML-3_H7VFTALXX_L2_1.fq.gz__merged.fq.gz
ML-3_H7VFTALXX_L2_2.fq.gz__2.fq.gz
T2S170523_H23HKDMXX_L1_1.fq.gz__1.fq.gz
T2S170523_H23HKDMXX_L1_1.fq.gz__merged.fq.gz
T2S170523_H23HKDMXX_L1_2.fq.gz__2.fq.gz
T4S170523_H23HKDMXX_L1_1.fq.gz__1.fq.gz
我想通过删除第一个'_'和'__'之间的内容来批量重命名它们。所以他们会是这样的:
BH_1.fq.gz
BH_merged.fq.gz
BH_2.fq.gz
BHos1_1.fq.gz
BHos1_merged.fq.gz
BHos1_2.fq.gz
BHos2_1.fq.gz
BHos2_merged.fq.gz
BHos2_2.fq.gz
ChLJ1511Da_1.fq.gz
ChLJ1511Da_merged.fq.gz
ChLJ1511Da_2.fq.gz
ChLJ1511Db_1.fq.gz
ChLJ1511Db_merged.fq.gz
ChLJ1511Db_2.fq.gz
ML-3_H7VFTALXX_1.fq.gz
ML-3_H7VFTALXX_merged.fq.gz
ML-3_H7VFTALXX_2.fq.gz
T2S170523_1.fq.gz
T2S170523_merged.fq.gz
T2S170523_2.fq.gz
T4S170523_1.fq.gz
如何制作? 非常感谢!
【问题讨论】:
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您需要提供更多信息,说明您做了哪些尝试,以及您所在的 Unix/Linux 系统类型,以及您是否允许使用非 shell 内置函数,这是一个正确的问题。跨度>
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我使用的是 linux ubuntu。我只想批量重命名这些文件。我试过
rename和mv,但是失败了。 -
发布那些失败的尝试没有问题。您是使用默认 shell 中的
rename还是 perl 中的rename? -
我正在使用默认 shell 中的
rename。我不知道如何在 perl 中启动rename。