Bash：重命名文件名的开头[重复]

Question

我有几个文件，如下所示：

1_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz
1_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_2.fastq.gz
2_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz
2_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_2.fastq.gz

...即，有两个以1_ 开头并以_1.fastq.gz 或_2.fastq.gz 结尾的文件，对于以2_ 开头的两个文件也是如此。我要做的是cat这两个以_1.fastq.gz结尾的文件，像这样：

cat 1_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz \ 
    2_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz \
    > 150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz

... 以便将它们合并并删除它们的前缀。我在比这更多的文件夹中有更多的文件，所以我想自动化它。我尝试了以下代码，但无济于事：

for f in *_*_1.fastq.gz
do
    cat $f "${f/^1_/2_}" > "${f/^1_/}"
done

我认为我不太了解这种替换方法，但它是我过去用于不太复杂的文件名的方法（当它们只有不同的后缀，没有前缀时）。我认为开头的^ 表示文件名的开始，但它似乎不像我想要的那样工作，所以很明显我做错了什么。我尝试进行一些故障排除：

for f in *_*_1.fastq.gz
    do
        echo "${f/^1_/}"
    done

...给我...

1_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz
2_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz

...这不是我想的那样。有人知道我该怎么做吗？

[编辑，澄清非重复问题]

这个问题与我之前的问题不同，我还有一个文件名前缀，而且这个前缀也存在于文件名的中间。另一个问题有一个更简单的情况，只有一个后缀是需要重命名的。

Answer 1

如果我处于我们的位置，假设目录中只有这种格式的文件，我会采用这样的程序：

$ ls | cut -b3- | sort -u | tee stems.lst # list the stems
$ while read stem; do cat *_$stem > $stem; done <stems.lst

在上线之前在测试目录中试试这个，否则你会弄乱文件名并且恢复起来会很痛苦。

结束语：

• 技巧：由于重定向，这里有点不方便，但首先在非破坏性模式下尝试while 命令更安全，方法是先运行某种形式的echo "cat *_$stem > $stem"，然后再用真实的东西替换它。
• 之后别忘了删除stem.lst
• 如果它是稳定的并且你需要重复，你可以直接从sort -u到while
• （如果此问题对处于相同情况的其他人有用）如果您的文件名包含任何奇怪的内容，请在 while 行中的任何位置用双引号将 $stem 括起来

Answer 2

找到“1”然后检查“2” 如果两者都 cat 它们一起并删除部分。

for f in 1_*_1.fastq.gz
do
      g="2_${f#1_}"
      if [ -f "$g" ]
      then
            cat "$f" "$g" > "${f#1_}" && rm "$f" "$g"
      fi
done