R根据数据框中的当前值替换值答案

【问题标题】：R replace value according to its current value in data frameR根据数据框中的当前值替换值
【发布时间】：2012-06-19 10:03:22
【问题描述】：

我有一个尺寸约为 ts1[100, 2000] 的数据框，如下所示：

> ts1[1:8, 1:6]
       DD LEVEL     X136747     X136749     X136752     X136753     ... ...
1 D04MX.x    LC        0.25        0.30       -0.01       -0.05
2 D08MX.x    LC        0.22        0.11        0.11        0.00
3 D15MX.x    LC        0.31        0.33       -0.23       -0.08
4 D29MX.x    LC        0.28        0.14       -0.28       -0.08
5 D04HX.x    SC        0.11       -0.26       -0.21       -0.33
6 D08HX.x    SC        0.25       -0.23       -0.07       -0.25
7 D15HX.x    SC        0.29        0.03       -0.05       -0.10
8 D29HX.x    SC        0.29        0.13       -0.09        0.02
... ...

我想将名为 X###### (ts1[3:ncol(ts1)]) 的列下所有介于 -0.1 和 0.1 之间的值替换为 0。我尝试了以下操作：

> ts1 <- ifelse(abs(ts1) < 1, 0, ts1)
Error in Math.data.frame(ts1) : 
  non-numeric variable in data frame: DDLEVEL
> ts1[which(abs(ts1) < 1)] <- 0
Error in Math.data.frame(ts1) : 
  non-numeric variable in data frame: DDLEVEL
> ts1[which(abs(is.numeric(ts1)) < 1)] <- 0
> ts1
  DD LEVEL X1367471_at X1367495_at X1367527_at X1367536_at
1  0    LC        0.25        0.30       -0.01       -0.05
2  0    LC        0.22        0.11        0.11        0.00
3  0    LC        0.31        0.33       -0.23       -0.08
... ...
> ts1 <- ts1[, lapply(.SD[3:ncol(ts1)], ifelse(abs(ts1) < 1, 0, ts1))]
Error in Math.data.frame(ts1) : 
  non-numeric variable in data frame: DDLEVEL

我做错了什么？我确实需要保留前两列。有什么捷径吗？谢谢。

【问题讨论】：

标签： r replace conditional dataframe

【解决方案1】：

假设你的数据被命名为df:

colsToEdit <- grepl("X", names(df))
df[, colsToEdit][abs(df[, colsToEdit]) <= 0.1] <- 0

给你：

 DD LEVEL X136747 X136749 X136752 X136753
1 D04MX.x    LC    0.25    0.30    0.00    0.00
2 D08MX.x    LC    0.22    0.11    0.11    0.00
3 D15MX.x    LC    0.31    0.33   -0.23    0.00
4 D29MX.x    LC    0.28    0.14   -0.28    0.00
5 D04HX.x    SC    0.11   -0.26   -0.21   -0.33
6 D08HX.x    SC    0.25   -0.23    0.00   -0.25
7 D15HX.x    SC    0.29    0.00    0.00    0.00
8 D29HX.x    SC    0.29    0.13    0.00    0.00

【讨论】：

非常感谢，它成功了。但是，在 Core 2 Due 2.5x GHz 桌面上完成 [164, 6247] 的数据帧需要 410 秒（约 7 分钟）。想知道有没有更快的方法？为什么我不能使用 df[,3:ncol(df)]，因为有时我可能在另一个列名中有一个“X”。
@user- 没有意识到速度会成为问题。可能有更快的方法，让我思考一下。对于您的另一个问题，这应该可以工作，尽管不是在比较检查...或调整您的正则表达式以更具选择性。