【发布时间】:2019-04-08 23:53:52
【问题描述】:
我正在使用 Pyarrow 库来优化 Pandas DataFrame 的存储。我需要尽可能快地逐行处理pyarrow Table而不将其转换为pandas DataFrame(它不适合内存)。 Pandas 有 iterrows()/iterrtuples() 方法。除了 for 循环和索引寻址,还有什么快速迭代 Pyarrow Table 的方法吗?
【问题讨论】:
我正在使用 Pyarrow 库来优化 Pandas DataFrame 的存储。我需要尽可能快地逐行处理pyarrow Table而不将其转换为pandas DataFrame(它不适合内存)。 Pandas 有 iterrows()/iterrtuples() 方法。除了 for 循环和索引寻址,还有什么快速迭代 Pyarrow Table 的方法吗?
【问题讨论】:
目前,该软件根本没有针对这个用例进行优化。我建议使用 Cython 或 C++ 或逐行与数据交互。如果您还有其他问题,请联系开发者邮件列表 dev@arrow.apache.org
【讨论】:
这段代码对我有用:
for batch in table.to_batches():
d = batch.to_pydict()
for c1, c2, c3 in zip(d['c1'], d['c2'], d['c3']):
# Do something with the row of c1, c2, c3
【讨论】:
如果您将大型 parquet 数据集拆分为多个文件,这似乎相当快且内存效率很高。
import argparse
import pyarrow.parquet as pq
from glob import glob
def parse_args():
parser = argparse.ArgumentParser()
parser.add_argument('parquet_dir')
return parser.parse_args()
def iter_parquet(dirpath):
for fpath in glob(f'{dirpath}/*.parquet'):
tbl = pq.ParquetFile(fpath)
for group_i in range(tbl.num_row_groups):
row_group = tbl.read_row_group(group_i)
for batch in row_group.to_batches():
for row in zip(*batch.columns):
yield row
if __name__ == '__main__':
args = parse_args()
total_count = 0
for row in iter_parquet(args.parquet_dir):
total_count += 1
print(total_count)
【讨论】: