knitr 从 1.2 更新到 1.4 错误：退出行

Question

我最近将 knitr 更新到 1.4，从那以后我的 .Rnw 文件无法编译。 文档内容丰富（7 章，包含在 child="" 中）。 现在，在最近的 knitr 版本中，我收到一条错误消息：

    Quitting from lines 131-792 (/DATEN/anna/tex/CoSta/chapter1.Rnw) 
    Quitting from lines 817-826 (/DATEN/anna/tex/CoSta/chapter1.Rnw) 
    Fehler in if (eval) { : 
    Argument kann nicht als logischer Wert interpretiert werden

（最后两行表示 knitr 正在寻找一个逻辑但它找不到它。 在第 131 行和第 817 行，两个数字结束。单独编译这些片段将起作用。 我不知道如何解决这个问题。 提前感谢任何可以解决我的问题的提示。

这里是 sessionInfo()

    R version 2.15.1 (2012-06-22)
    Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

    locale:
      [1] LC_CTYPE=de_DE.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
      [3] LC_TIME=de_DE.UTF-8        LC_COLLATE=de_DE.UTF-8    
      [5] LC_MONETARY=de_DE.UTF-8    LC_MESSAGES=de_DE.UTF-8   
      [7] LC_PAPER=C                 LC_NAME=C                 
      [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
      [11] LC_MEASUREMENT=de_DE.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

      attached base packages:
      [1] tools     stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods  
      [8] base     

      other attached packages:
      [1] knitr_1.4

      loaded via a namespace (and not attached):
      [1] compiler_2.15.1 digest_0.6.3    evaluate_0.4.7  formatR_0.9    
      [5] stringr_0.6.2   tcltk_2.15.1   

按照Hui的建议，我分别运行每一章 针织（“第1章.Rnw”） 等等。不会出现错误消息，并创建单独的 tex 文件。为了提供更多信息，我显示了部分代码。 有一个主文档，其中设置了几个选项

     <<options-setting,echo=FALSE>>=
     showthis <- FALSE
     evalthis <- FALSE
     evalchapter <- TRUE
     opts_chunk$set(comment=NA, fig.width=6, fig.height=4)
     @

每个章节都通过子块使用，例如第 1 章是从

调用的

     <<child-chapter1, child='chapter1.Rnw', eval=evalchapter>>=
     @

上面给出了编织主 Rnw 文件时出现的错误消息。 相关的Figure环境如下

     \begin{figure}[ht]
       \centering
      <<wuerfel-simulation,echo=showthis,fig.height=5>>=
      data.sample6 <- sample(1:6,repl=TRUE,100)
      table(data.sample6)
      barplot(table(data.sample6)/100,col=5,main="Haeufigkeiten beim Wuerfeln")
      @ 
      \caption{Visualisierung beim W"urfeln. 100 Versuche.}
      \label{fig:muent-vis}
      \end{figure}

这不是很高级，但是错误还是和之前给出的一样。 退出行涉及一个长文本，从第 131 行（第一个块的结尾）到第 792 行（后续块的开始），即

       << zeiten, echo=showthis,eval=evalthis>>=
       zeiten <- c(17,16,20,24,22,15,21,15,17,22)
       max(zeiten)
       mean(zeiten)
       zeiten[4] <- 18; zeiten
       mean(zeiten)
       sum(zeiten > 20)
       @

正确关闭块有问题吗？

我现在找到了错误，并提供了一段带有可重现错误消息的短代码。它涉及对涉及 Sexpr 的子进程的条件评估：

主文件如下

    \documentclass{article}
    \begin{document}
    <<options-setting,echo=FALSE>>=
    evalchapter <- TRUE
    @
    <<test,child="test-child.Rnw", eval=evalchapter>>=
    @ 
    \end{document}

相关的子文件'test-child.Rnw'是

     <<no-sexpr>>=
     t <- 2:4
     @ 
     text \Sexpr{(t <- 2:4)}

按“原样”编织此错误消息会从上面给出错误消息。去除孩子的 Sexpr 一切都很好。 但是，如果我删除子文件调用中的条件，即没有 'eval=evalchapter'

由于我经常使用 Sexpr，因此我希望找到解决此问题的方法。正如我之前提到的，在 knitR 版本 1.2 之前没有任何问题。

Answer 1

这与 knitr 1.3 的变化有关，在NEWS 中提到：

在knit_child() 中添加了参数options 来设置子文档的全局块选项；如果父块调用子文档（通过child 选项），则父块的块选项将用作子文档的全局选项，例如对于<<foo, child='bar.Rnw', fig.path='figure/foo-'>>=，图形路径前缀将是figure/foo- in bar.Rnw；申请见How to avoid figure filenames in child calls

这导致了内联 R 代码的错误。在您的情况下，块选项 eval=evalchapter 在用于评估内联代码时未评估。我已经修复了development version v1.4.5 on Github 中的错误。