我正在尝试遍历特定文件夹中的一些文件以在每个文件中执行特定操作（使用神经成像工具 FSL）。
当我这样做时
$ find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/
它返回该文件夹中所有文件的列表
原来如此
$ for i in 'find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/';do /usr/share/fsl/5.0/bin/bet $i ${i}_brain -f 0.4 -g 0;done
但结果是
Error: input image find not valid
我能够在 CentOS 7 中做到这一点，所以我猜这可能是问题的根源......
【问题讨论】：
标签： bash shell centos ubuntu-16.04
你需要一个shell glob：
$ for i in /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/*; do
bet "$i" "${i}_brain" -f 0.4 -g 0
done
【讨论】：
将-exec 选项用于find：
find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/ -exec /usr/share/fsl/5.0/bin/bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;
对于那些喜欢将代码分散在多行中的人：
find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/ \
-exec /usr/share/fsl/5.0/bin/bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;
假设我们有一个包含这些文件的目录：
$ find .
.
./dir1
./dir1/file2
./dir1/file1
我们可以对这些文件中的每一个运行echo 命令，以表明文件名已正确替换为命令：
$ find . -exec echo bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;
bet . ._brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1 ./dir1_brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1/file2 ./dir1/file2_brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1/file1 ./dir1/file1_brain -f 0.4 -g 0
如果您只希望命令在常规文件而不是目录上运行，请添加 -type f 测试：
$ find . -type f -exec echo bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;
bet ./dir1/file2 ./dir1/file2_brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1/file1 ./dir1/file1_brain -f 0.4 -g 0
【讨论】：
$i 修复 --> {}。
您的脚本应该可以进行以下调整：
IFS=$'\n' for i in $(find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/)
do
/usr/share/fsl/5.0/bin/bet "$i" "${i}_brain" -f 0.4 -g 0
done
$(...) 语法用于将 find 作为单独的命令启动，而不是创建字符串文字 'find ... '。
IFS 是分隔find 返回的结果的分隔符。我们必须更新它，否则带有空格的文件名将分别分配给i。
这里的答案解释了why the $ in IFS=$'\n' is necessary。
【讨论】：
$i，因此我假设文件的名称类似于mriscan00001.png 到mriscan12345.png。但是，是的，你是对的，它非常脆弱。非常脆弱。