RPostgreSQL 安装错误 - RPostgreSQL.so：未定义符号：PQpass答案

【问题标题】：RPostgreSQL installation Error - RPostgreSQL.so: undefined symbol: PQpassRPostgreSQL 安装错误 - RPostgreSQL.so：未定义符号：PQpass
【发布时间】：2014-07-12 08:34:48
【问题描述】：

我正在尝试安装 R-Package RPostgreSQL，但出现以下错误，

Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
  unable to load shared object '/usr/lib64/R/library/RPostgreSQL/libs/RPostgreSQL.so':
  /usr/lib64/R/library/RPostgreSQL/libs/RPostgreSQL.so: undefined symbol: PQpass
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
* removing ‘/usr/lib64/R/library/RPostgreSQL’

我安装了libpq 和postgresql-dev。所有的库文件都在目录中

/usr/lib64/pgsql/和所有头文件都在目录中

/usr/include/pgsql/

Postgre 版本 - 9.3.4 R 版本 - 3.0.2 操作系统 - CentOS-6.4

我遗漏了一些小东西，但无法找出发生这种情况的原因。

我做错了什么？如何纠正这个问题？

【问题讨论】：

我想说找到的libpq.so 与RPostgreSQL.so 最初链接的那个不同。 ldd /usr/lib64/R/library/RPostgreSQL/libs/RPostgreSQL.so 请。

标签： r centos rpostgresql

【解决方案1】：

看起来 pgsql 库不再安装在它们以前的位置。我链接了两者：

ln -s /usr/pgsql-9.3/lib /usr/lib/pgsql

ln -s /usr/pgsql-9.3/include /usr/include/pgsql

这对我有用:)

【讨论】：

【解决方案2】：

RPostgreSQL 包仅在以下目录路径中检查 PostgreSQL 库，

    /usr/lib 
/usr/lib/pgsql 
/usr/lib/postgresql 
/usr/local/lib 
/usr/local/lib/pgsql 
/usr/local/lib/postgresql 
/usr/local/pgsql/lib 
/usr/local/postgresql/lib 
/opt/lib 
/opt/lib/pgsql 
/opt/lib/postgresql 
/opt/local/lib 
/opt/local/lib/postgresql 
/opt/local/lib/postgresql84 
/sw/opt/postgresql-8.4/lib 
/Library/PostgresPlus/8.4SS/lib 
/sw/lib

它不会检查LD_LIBRARY_PATH 或/etc/ld.so.conf 中的目录。

因此，只有在上述任何目录中存在 PostgreSQL 库时，RPostgreSQL 安装才会成功。

当我将库从 /usr/lib64/pgsql 复制到 /usr/lib/pgsql 并尝试安装包时。有效。 :)

【讨论】：

您的回答帮助我安装了它。但是检查包中的配置文件，结果发现它首先检查了pg_config --libdir。我需要做的就是确保pg_config 在PATH 中可见。
@user1071847 你能解释一下如何让 pg_config 在 PATH 中可见吗？
@Andy：（这是针对 Linux 的。）在我的 .bash_profile 文件中，我将 PATH 编辑为 PATH=$HOME/bin:$HOME/usr/bin:$HOME/usr/local/pgsql/bin:$PATH。在您的情况下，您必须将 $HOME/usr/local/pgsql/bin 替换为 pg_config 的任何路径，当然，除最后一个之外的所有其他路径组件仅用于我的设置。