Neo4j：密码中的无效输入

Question

我正在开展一个项目，该项目旨在建立一个系统来检索生物医学信息（例如，药物、疾病和基因等生物医学实体，以及它们之间的关系）。当我尝试使用 cypher 语句检索数据库以查找特定疾病时：

对于密码字符串MATCH (m:Disease) WHERE m.disease_name =~ '(?i)"+disease+"' RETURN m;

如果疾病名称为2'-benzoyloxycinnamaldehyde 或4-[1-ALLYL-7-(TRIFLUOROMETHYL)-1H-INDAZOL-3-YL]BENZENE-1,3-DIOL，则会出现以下异常消息：

无效输入 '"'：应为 0..9、'.'、'e'、'E'、标识符字符、空格、节点标签、'['、"=~"、IN、STARTS、ENDS , 包含, IS, '^', '*', '/', '%', '+', '-', '=', "", "!=", '' , "=", AND, XOR, OR, LOAD CSV, START, MATCH, UNWIND, MERGE, CREATE, SET, DELETE, REMOVE, FOREACH, WITH, Return, UNION, ';'或输入结束（第 1 行，第 53 列（偏移量：52）） "MATCH (n1:Drug)-[x]-(n2:Disease) RETURN n1 LIMIT 25""

我该如何解决这个问题？非常感谢！

Answer 1

您实际上有 2 个不同的查询，它们有不同的问题：

1. 第一个查询是由这个语句生成的：

   "MATCH (m:Disease) WHERE m.disease_name =~ '(?i)"+disease+"' RETURN m";
   

   由于您使用单引号作为正则表达式字符串分隔符，如果disease 值包含单引号，那么这将过早结束正则表达式。您有多种选择，按质量不断提高：

   • 转义（使用前面的反斜杠）disease 中的所有单引号字符。

   • 使用双引号作为正则表达式字符串分隔符（也需要转义字符，但 disease 不需要更改）。我假设disease（实际上似乎是一个化学名称）永远不会包含双引号：

     "MATCH (m:Disease) WHERE m.disease_name =~ \"(?i)" + disease + "\"RETURN m";
     

   • 将disease 值作为parameter 传递。不需要转义，如果您需要多次进行基本相同的查询，查询会更快。但是，传入的参数值必须以“(?i)”开头。

     "MATCH (m:Disease) WHERE m.disease_name =~ {disease} RETURN m";

2. 您的第二个查询有一个简单的错字。它的末尾有一个额外的双引号：

   "MATCH (n1:Drug)-[x]-(n2:Disease) RETURN n1 LIMIT 25""
   

   应该是：

   "MATCH (n1:Drug)-[x]-(n2:Disease) RETURN n1 LIMIT 25"