igraph 两个顶点之间的边

Question

我是 R 和 igraph 的新手，我想知道是否有人可以帮助我解决以下问题。

我想在图中找到两个顶点之间的边权重。我的图结构由正常的自我（node1）、alter（节点2）和它们之间的边的权重定义。

我知道我可以使用 E(igraph_friendship) [ from(5) ]$weight 获得源自节点 5 的边列表中每个边的权重 并且我可以使用 E(igraph_friendship) [ to(10) ]$weight

找到结束到节点号 10 的边列表中每个边的权重

但是，如果我只想找到仅连接节点 5 和节点 10 的边的权重怎么办？

或者，如果我可以在所有边列表中获得连接节点 5 和 10 的边的标识符 E(igraph_friendship)，那也可以。

非常感谢您的帮助，我一直在寻找它，非常感谢您的帮助！

Answer 1

这在 igraph 0.6 及更高版本中实际上很容易，因为你可以 将图视为邻接矩阵（或加权邻接 你的情况下的矩阵）：

library(igraph)
g <- graph.ring(10)
g[1,2]
# [1] 1
E(g)$weight <- runif(ecount(g))
g[1,2]
# [1] 0.8115639

如果你想为整个矩阵做这个，那么你可以简单地做

g[]

或者，如果你不想要稀疏矩阵，那么

g[sparse=FALSE]

更多信息请查看?"[.igraph"。

Answer 2

Gabor 对邻接矩阵的使用有所帮助。但是，我花了一段时间才弄清楚如何将带有权重的边缘列表放入邻接矩阵中。我尝试使用 graph.data.frame 以通常的方式执行此操作，但是当我尝试将 igraph 对象转换为邻接矩阵时会出现奇怪的错误（错误：.M.kind(x) 中的错误：尚未为矩阵实现w/ typeof 字符）。这篇文章帮助解决了这个问题：https://sites.google.com/site/daishizuka/toolkits/sna/weighted-edgelists。

但是，我从 R 帮助电子邮件列表中发现，最有效的方法是直接在 igraph 对象上使用这个简单的运算符：E(g)[5 %--% 10]$weight。详情见http://igraph.sourceforge.net/doc/R/iterators.html