如何在 PyCharm 中将 RDKit 添加到项目中？答案

【问题标题】：How to add RDKit to project in PyCharm?如何在 PyCharm 中将 RDKit 添加到项目中？
【发布时间】：2023-03-18 13:57:01
【问题描述】：

所以，我正在尝试将 RDKit 添加到我在 PyCharm 中的项目中。我发现如果你使用解释器/usr/bin/python2.7 PyCharm 将尝试使用pip 安装东西。而 RDKit 需要 conda。我试图将解释器更改为conda，但RDKit 不在列表中，或者无法打开带有repo 的URL。有谁知道如何解决这个问题？

顺便说一句，是否有可能在保持解释器/usr/bin/python2.7 使其使用其他任何东西（不是pip）的同时安装东西？

【问题讨论】：

安娜你在 RDKit 邮件列表上问过这个吗？ IMO 你更有可能在那里得到答案。
@ncfirth 谢谢你，试试看）

标签： python pycharm rdkit

【解决方案1】：

我终于找到了方法，而且一点也不难：

安装 conda；
安装RDKit，关注these instructions
像这样进入 PyCharm 中的首选项：

或者像这样（你需要一把扳手）：

在项目解释器中选择：~/anaconda/envs/my-rdkit-env/bin/python
一定要在PATH中添加或更新对应的python路径，否则不起作用。

测试：

已尝试安装 fiona - 成功，因此对安装没有影响；
尝试了简单的代码：print('HELLO WORLD!') - 有效

试过rdkit代码

    from rdkit import Chem


    m = Chem.MolFromSmiles('Cc1ccccc1')

    print(m)

工作，日志：<rdkit.Chem.rdchem.Mol object at 0x101125080>

【讨论】：

【解决方案2】：

另一个选项是在 PyCharm 中创建新项目时选择现有的虚拟环境。一旦你完成了 Anna 上面列出的步骤，“创建项目”屏幕的“以前配置的解释器”部分应该显示 ~/anaconda/envs/my-rdkit-env/bin/python 作为选项。

【讨论】：