【发布时间】：2017-12-26 20:07:09
【问题描述】：
我想从 BioConductor 安装 phyloseq。当我这样做并尝试加载它时，我收到关于 igraph 的错误（即使我将依赖项设置为 TRUE）。我曾尝试独立安装 igraph，但也无法正常工作，退出状态非零。
我正在使用 RStudio
R 版本 3.4.0 (2017-04-21)
平台：x86_64-apple-darwin15.6.0（64位）
运行于：OS X El Capitan 10.11.6
有人有什么建议吗？错误粘贴在下面。
感谢您的帮助！
这是我的命令：
install.packages("phyloseq", dependencies = TRUE)
这里是警告：
install.packages 中的警告：
依赖“igraph”不可用
这里我尝试加载我想要的包：library("phyloseq")
这里是警告：错误：
loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]])中“phyloseq”的包或命名空间加载失败。没有名为“igraph”的包
这里我尝试直接安装igraph：install.packages("igraph", dependencies = TRUE)
这里是编译失败：
错误：install.packages 中的包“graph”警告编译失败：
installation of package ‘igraph’ had non-zero exit status
【问题讨论】：
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你在命令行安装了xcode吗？
标签： r installation package