无法在 conda 环境中安装 bioconda 包

Question

我正在尝试从 anaconda 中的 Bioconda 频道安装一些软件包，但即使添加了频道，我也会遇到以下错误：

C:\Users\matti>conda install -c bioconda pybedtools
Solving environment: failed

PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:

  - pybedtools

Current channels:

  - https://conda.anaconda.org/bioconda/win-64
  - https://conda.anaconda.org/bioconda/noarch
  - https://conda.anaconda.org/conda-forge/win-64
  - https://conda.anaconda.org/conda-forge/noarch
  - https://repo.continuum.io/pkgs/main/win-64
  - https://repo.continuum.io/pkgs/main/noarch
  - https://repo.continuum.io/pkgs/free/win-64
  - https://repo.continuum.io/pkgs/free/noarch
  - https://repo.continuum.io/pkgs/r/win-64
  - https://repo.continuum.io/pkgs/r/noarch
  - https://repo.continuum.io/pkgs/pro/win-64
  - https://repo.continuum.io/pkgs/pro/noarch
  - https://repo.continuum.io/pkgs/msys2/win-64
  - https://repo.continuum.io/pkgs/msys2/noarch
  - https://conda.anaconda.org/daler/win-64
  - https://conda.anaconda.org/daler/noarch
  - https://conda.anaconda.org/anaconda-fusion/win-64
  - https://conda.anaconda.org/anaconda-fusion/noarch

其他 bioconda 软件包（如 bowtie2）也会发生这种情况。我已经尝试过常规的 pip install 和 easy_install 但它们也不起作用。有任何想法吗？

Answer 1

您尝试过以下命令吗？

conda install --channel bioconda/label/bioconda-utils-test package

或

conda install -c conda-forge python-utils

Answer 2

从您的命令行显示您在 Windows 上。 bioconda 上有几个pybedtools 的版本，但是，如果我通过它们 grep，它们都是针对 linux 平台的。

如果您使用的是 Windows 10，则可以考虑设置“Linux 的 windows 子系统”（可能还有 Xming），安装 conda，然后安装 pybedtools。这显然是一种冗长的方法，但会为您打开许多 bioconda 包