R的命令行参数[重复]

Question

可能重复：
Parsing command line arguments in R scripts

这是我在这里的第一篇文章，如果我要问一些菜鸟问题或已经回答的问题，请多多关照。

我编写了一个 R 脚本，它将文件作为输入并计算第二列的连续数据点之间的差异，并绘制计算出的差异点的直方图。

一切都很好，但我希望该脚本将输入作为命令行参数。我尝试了 --args 和 --slave 但它不起作用！我如何实现它？而且脚本非常慢，因为我使用 2 个 for 循环编写它，处理 50k 行文件需要 10 分钟，而 awk 在 30 秒内完成此操作。有什么技巧可以加快速度？？

数据如下所示：

CHROM   POS
chr01   925
chr01   929
chr01   981
chr01   1008
chr01   1012
chr01   1042
chr01   1065
chr01   1255
chr01   1260

谢谢。

Answer 1

您可以访问通过commandArgs() 函数传递给R 的命令行参数。这将返回一个您可以以通常方式访问的列表。详情请见?commandArgs。