【发布时间】:2015-06-04 19:50:15
【问题描述】:
起点:
m <- matrix(c(12,9,8,31), nrow=2)
(m.obs <- m.exp <- addmargins(m, FUN=sum, quiet=T))
我有以下代码:
m.exp[1,1] <- m.obs[1,3] / m.obs[3,3] * m.obs[3,1]
m.exp[1,2] <- m.obs[1,3] / m.obs[3,3] * m.obs[3,2]
m.exp[2,1] <- m.obs[2,3] / m.obs[3,3] * m.obs[3,1]
m.exp[2,2] <- m.obs[2,3] / m.obs[3,3] * m.obs[3,2]
这可以写成一个嵌套循环如下:
for (row in 1:2) {
for (column in 1:2) {
m.exp[row,column] <- m.obs[row,3] / m.obs[3,3] * m.obs[3,column]
}
}
我的问题是这是否也可以以矢量化形式编写。有没有不同的方法可以矢量化这段代码?还是有其他方法可以简化它?
我的目标是找到不同的可能性来说明如何在 R 中使代码更快和/或更优雅。这个想法当然是拥有比这个玩具示例大得多的矩阵。
此示例的背景是根据chi-squared test 的观察频率计算预期频率矩阵。
【问题讨论】:
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请提供
m.exp和m.obs的示例值(例如使用dput)。 -
@JoshuaUlrich:我也添加了一些背景信息
标签: r optimization vectorization simplify